MirGeneDB ID | Dsi-Iab-4-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | IAB-4 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UACGUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dsi-mir-iab-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dsi-Iab-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Iab-4 Aga-Iab-4-as Bge-Iab-4 Bge-Iab-4-as Dan-Iab-4 Dan-Iab-4-as Dlo-Iab-4 Dlo-Iab-4-as Dma-Iab-4 Dme-Iab-4 Dme-Iab-4-as Dmo-Iab-4 Dmo-Iab-4-as Dpu-Iab-4 Dpu-Iab-4-as Dya-Iab-4 Dya-Iab-4-as Gpa-Iab-4 Hme-Iab-4 Hme-Iab-4-as Isc-Iab-4 Tca-Iab-4 Tca-Iab-4-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
3R: 8574020-8574079 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Iab-4-as) |
Iab-4
3R: 8574020-8574076 [-]
UCSC
Ensembl
Iab-4-as 3R: 8574020-8574079 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CACAUCCCACGUUGCUCGUGCUAUCUCGUGUUACGUAUACUGAAGGUAUACCGGAUAGGAUACACUCAGGAUACAUUCAGUAUACGUUUACGAGGUCGCACAGAAUCGCCAUUAUCCAAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CACAUCCCACGUUGCUC--| U UU G A GGAUAGG GUGC AUCUCGUG ACGUAUACUGAA GUAU CC A CACG UGGAGCAU UGCAUAUGACUU CAUA GG U AAACCUAUUACCGCUAAGA^ C U- A - ACUCACA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dsi-Iab-4-as_5p |
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mirBase accession | MIMAT0012504 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUACGUAUACUGAAGGUAUACCGG -24
Get sequence
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Star sequence | Dsi-Iab-4-as_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0012505 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AGGAUACAUUCAGUAUACGUUUA -60
Get sequence
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