| MirGeneDB ID | Esc-Mir-10-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-10 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUACCCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Hawaiian bobtail squid (Euprymna scolopes) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Esc-Mir-10-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Adi-Mir-10 Agr-Mir-10-P6 Asp-Mir-10 Cte-Mir-10-P6 Eba-Mir-10-P6 Efe-Mir-10-P6 Hru-Mir-10-P6 Lgi-Mir-10-P6 Lhy-Mir-10-P6 Mgi-Mir-10-P6 Mom-Mir-10-P6 Npo-Mir-10-P6 Nve-Mir-10 Obi-Mir-10-P6 Ofu-Mir-10-P6 Ovu-Mir-10-P6 Pve-Mir-10-P6 Rph-Mir-10-P6 War-Mir-10-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eumetazoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_004765925.1_miRNA_LOCI) |
Esc-Mir-10-P6_pre_SRIE01021191.1:8354863-8355003: 41-101 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUAACCGAAUAUUUGCAGUCGAGGGAAAGACUUACCCUGUAAAUCGGAGAAGUGUCAAAUUAGACAAGCUUCUCGUUUCACAGGGUAUAUUUAUCCCACGGCAACAGUCAUCAAGAUGAACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUAACCGAAUAUUUGCA-- A A CU -| CG GUCAAA GUCG GGGA AGA UACCCUGU AAAU GAGAAGU U CGGC CCCU UUU AUGGGACA UUUG CUCUUCG U CAAGUAGAACUACUGACAA A A AU C^ -- AACAGA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Esc-Mir-10-P6_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUUACCCUGUAAAUCGGAGAAGU -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Esc-Mir-10-P6_3p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUCUCGUUUCACAGGGUAUAUU -61
Get sequence
|
