MirGeneDB ID | War-Mir-10-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-10 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUACCCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Wirenia (Solenogaster) (Wirenia argentea) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | War-Mir-10-P1 War-Mir-10-P2s War-Mir-10-P2t War-Mir-10-P3 War-Mir-10-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Adi-Mir-10 Agr-Mir-10-P6 Asp-Mir-10 Cte-Mir-10-P6 Eba-Mir-10-P6 Efe-Mir-10-P6 Esc-Mir-10-P6 Hru-Mir-10-P6 Lgi-Mir-10-P6 Lhy-Mir-10-P6 Mgi-Mir-10-P6 Mom-Mir-10-P6 Npo-Mir-10-P6 Nve-Mir-10 Obi-Mir-10-P6 Ofu-Mir-10-P6 Ovu-Mir-10-P6 Pve-Mir-10-P6 Rph-Mir-10-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eumetazoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_025802215.1_ASM2580221v1_Wirenia) |
WNLI01106048.1: 3757-3815 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCAGACCUACCAUGUGUCGUGCUGAGCCACUUACCCUGUCAAUCGGAGAAAGUGUUCCAGACCCACUUCUCGUUUUACAGGGUAUAUUGCUCGGCAUGAACCGCUUCAAAACACAGCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CUCAGACCUACCAUGUG--| CACU C UCG AGUGUUC UCGUGCUGAGC UACCCUGU AA GAGAA C AGUACGGCUCG AUGGGACA UU CUCUU A ACGACACAAAACUUCGCCA^ UUAU U UG- CACCCAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | War-Mir-10-P6_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUUACCCUGUCAAUCGGAGAAAG -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | War-Mir-10-P6_3p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UUCUCGUUUUACAGGGUAUAUU -59
Get sequence
|