MirGeneDB ID | Gga-Mir-155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-155 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAAUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Chicken (Gallus gallus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | gga-mir-155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-155 Ami-Mir-155 Bta-Mir-155 Cfa-Mir-155 Cja-Mir-155 Cli-Mir-155 Cmi-Mir-155 Cpi-Mir-155 Cpo-Mir-155 Dno-Mir-155 Dre-Mir-155 Ebu-Mir-155 Eca-Mir-155 Ete-Mir-155 Gja-Mir-155 Gmo-Mir-155 Hsa-Mir-155 Laf-Mir-155 Lch-Mir-155 Loc-Mir-155 Mal-Mir-155 Mdo-Mir-155 Mml-Mir-155 Mmr-Mir-155 Mmu-Mir-155 Mun-Mir-155 Neu-Mir-155 Oan-Mir-155 Ocu-Mir-155 Pab-Mir-155 Pbv-Mir-155 Pma-Mir-155 Rno-Mir-155 Sha-Mir-155 Spt-Mir-155-P3 Spt-Mir-155-P4 Sto-Mir-155 Tgu-Mir-155 Tni-Mir-155 Xla-Mir-155-P1 Xla-Mir-155-P2 Xtr-Mir-155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Gallus_gallus.GRCg6a) |
1: 103797405-103797465 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCUAGAGUUCUUCUGUAGGCUGUAUGUUGUUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUUUUUACCUCUGAAUGACUCCUACAUGUUAGCAUUAACACUGUACCAUGCCUCUCAUCAGAACUCACAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CUCUAGAGUUCUUCUGUA U--| GU U A UUUACC GGC GUAU UGUUAAUGCUAA CGUG UAGGGGUU \ CCG CAUG ACAAUUACGAUU GUAC AUCCUCAG U AACACUCAAGACUACUCU UAC^ UC - - UAAGUC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Gga-Mir-155_5p |
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mirBase accession | MIMAT0001106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGGUU -24
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: gga-miR-155 miRDB: MIMAT0001106 |
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Star sequence | Gga-Mir-155_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CUCCUACAUGUUAGCAUUAACA -61
Get sequence
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