| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-378 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUGGACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-378 Cja-Mir-378 Cpo-Mir-378 Dno-Mir-378 Eca-Mir-378 Ete-Mir-378 Hsa-Mir-378 Laf-Mir-378 Mml-Mir-378 Mmr-Mir-378-P1 Mmr-Mir-378-P2 Mmr-Mir-378-P3 Mmu-Mir-378 Ocu-Mir-378 Pab-Mir-378 Rno-Mir-378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr4: 59276347-59276406 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCAGCCAGCGGGUGACAGAGCCACCCAGGGCUCCUGACUCCAGGUCCUGUGUGUUACCUCGAAAUAGCACUGGACUUGGAGUCAGAAGGCCUGAGUGGAGUCGCCUUCCCCACUCUCUGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GCAGCCAGCGGGUGACA- G-| C G C U GUUACC GA CCAC CAGG CU CUGACUCCAGGUCC GUGU U CU GGUG GUCC GA GACUGAGGUUCAGG CACG C GGUCUCUCACCCCUUCCG GA^ A G A U AUAAAG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cfa-Mir-378_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cfa-Mir-378_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- ACUGGACUUGGAGUCAGAAGGC -60
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-378 miRDB: MIMAT0006683 |
