| MirGeneDB ID | Ete-Mir-1247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1247 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCCGUCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1247-v1 Bta-Mir-1247-v2 Cfa-Mir-1247 Cja-Mir-1247 Cpo-Mir-1247 Dno-Mir-1247 Eca-Mir-1247-v1 Eca-Mir-1247-v2 Hsa-Mir-1247 Laf-Mir-1247 Mml-Mir-1247 Mmr-Mir-1247 Mmu-Mir-1247 Ocu-Mir-1247 Pab-Mir-1247 Rno-Mir-1247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (echTel2) |
JH980297: 81608636-81608693 [+] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | NNNNNNGGCGCAGCCCUGGCCGCUGGGCGCACCCGUCCCGUGCGUCCCCGGACGUGGCUCUCAGCCCCGGGAACGUCGAGACUGGAGCGCCGGAGCCGAGCCGCCCUCGGCGACCCCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 NNNNNNGGCGCAGCCCU----| CG G A C C U C ACGUGGC GGC CUGG CGC CC GUC CG GCGU CCCGG \ CCG GGCC GCG GG CAG GC UGCA GGGCC U GCCCCAGCGGCUCCCGCCGAG^ A- - A U A - A CCGACUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ete-Mir-1247_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACCCGUCCCGUGCGUCCCCGGA -22
Get sequence
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| Star sequence | Ete-Mir-1247_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CGGGAACGUCGAGACUGGAGC -58
Get sequence
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