MirGeneDB ID | Hsa-Mir-1247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1247 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CCCGUCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-1247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-1247-v1 Bta-Mir-1247-v2 Cfa-Mir-1247 Cja-Mir-1247 Cpo-Mir-1247 Dno-Mir-1247 Eca-Mir-1247-v1 Eca-Mir-1247-v2 Ete-Mir-1247 Laf-Mir-1247 Mml-Mir-1247 Mmr-Mir-1247 Mmu-Mir-1247 Ocu-Mir-1247 Pab-Mir-1247 Rno-Mir-1247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr14: 101560326-101560383 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCGCCCAGCGCAGCCCCGGCCGCUGGGCGCACCCGUCCCGUUCGUCCCCGGACGUUGCUCUCUACCCCGGGAACGUCGAGACUGGAGCGCCCGAACUGAGCCACCUUCGCGGACCCCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UCGCCCAGCGCAGCCCCGGCCGC--| A C C UU C ACGUUGC UGGGCGC CC GUC CG CGU CCCGG \ GCCCGCG GG CAG GC GCA GGGCC U GCCCCAGGCGCUUCCACCGAGUCAA^ A U A U- A CCAUCUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-1247_5p |
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mirBase accession | MIMAT0005899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACCCGUCCCGUUCGUCCCCGGA -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005899 TargetScanVert: hsa-miR-1247-5p TargetMiner: hsa-miR-1247-5p miRDB: MIMAT0005899 |
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Star sequence | Hsa-Mir-1247_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0022721 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- CGGGAACGUCGAGACUGGAGC -58
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: hsa-miR-1247-3p TargetMiner: hsa-miR-1247-3p miRDB: MIMAT0022721 |