| MirGeneDB ID | Gga-Mir-128-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-128 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CACAGUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Chicken (Gallus gallus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | gga-mir-128-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Gga-Mir-128-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-128-P2 Ami-Mir-128-P2 Bta-Mir-128-P2 Cfa-Mir-128-P2 Cja-Mir-128-P2 Cli-Mir-128-P2 Cmi-Mir-128-P2 Cpi-Mir-128-P2 Cpo-Mir-128-P2 Dno-Mir-128-P2 Dre-Mir-128-P2a Dre-Mir-128-P2b Ebu-Mir-128 Eca-Mir-128-P2 Ete-Mir-128-P2 Gja-Mir-128-P2 Gmo-Mir-128-P2a Gmo-Mir-128-P2b Hsa-Mir-128-P2 Laf-Mir-128-P2 Lch-Mir-128-P2 Loc-Mir-128-P2 Mal-Mir-128-P2a Mdo-Mir-128-P2 Mml-Mir-128-P2 Mmr-Mir-128-P2 Mmu-Mir-128-P2 Mun-Mir-128-P2 Neu-Mir-128-P2 Oan-Mir-128-P2 Ocu-Mir-128-P2 Pab-Mir-128-P2 Pbv-Mir-128-P2 Pma-Mir-128-o2 Rno-Mir-128-P2 Sha-Mir-128-P2 Spt-Mir-128-P2 Sto-Mir-128-P2 Tgu-Mir-128-P2 Tni-Mir-128-P2a Xla-Mir-128-P2c Xla-Mir-128-P2d Xtr-Mir-128-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Gallus_gallus.GRCg6a) |
7: 30614336-30614391 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGGAUGGCCUGACUUUGAGCUGUUGAAUUCGGGGCCGUAACACUGUCUGAGAGGUUUAUAUUUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUUCAGCUGCUUCCUGGCUUCCUUUUUAAAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UGGGAUGGCCUGACUUU--| U UUC UAA CU GGUU GAGC GUUGAA GGGGCCG CACUGU GAGA U UUCG CGACUU CUCUGGC GUGACA CUCU A GAAAUUUUUCCUUCGGUCC^ U UUU CAA -- UUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Gga-Mir-128-P2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0031096 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGGGGCCGUAACACUGUCUGAGA -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: gga-miR-128-1-5p miRDB: MIMAT0031096 |
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| Mature sequence | Gga-Mir-128-P2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0001123 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UCACAGUGAACCGGUCUCUUU -56
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: gga-miR-128-3p miRDB: MIMAT0001123 |
