| MirGeneDB ID | Lhy-Mir-1986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1986 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGAUUUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Laevipilina (Monoplacophora) (Laevipilina hyalina) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-1986 Cte-Mir-1986 Eba-Mir-1986 Efe-Mir-1986 Hru-Mir-1986-P1 Hru-Mir-1986-P2 Lan-Mir-1986 Lgi-Mir-1986 Mgi-Mir-1986 Mom-Mir-1986 Npo-Mir-1986 Obi-Mir-1986 Ofu-Mir-1986 Ovu-Mir-1986 Pdu-Mir-1986 Pve-Mir-1986-P3 Pve-Mir-1986-P4 Pve-Mir-1986-P5 Rph-Mir-1986 War-Mir-1986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Mono_atcgn_nospaces) |
scaffold472284_24.8: 624-681 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUCAUUUAUUUGAUUCAAGGUGUUUGCGAUCGCGGGUCAUGGGGAGGUCAUUGUGGACUAGAAUAGUGGAUUUCCCAAGAUCCGUGAUCGUAAUAUACCGUCACCAUCAAUUAUCUGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUCAUUUAUUUGAUUCAA- -| A GU GUGGA GGUGU UUGCGAUCGCGGGUC UGGGGAG CAUU C CCAUA AAUGCUAGUGCCUAG ACCCUUU GUGA U CGUCUAUUAACUACCACUG U^ A AG UAAGA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lhy-Mir-1986_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGCGGGUCAUGGGGAGGUCAUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Lhy-Mir-1986_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UGGAUUUCCCAAGAUCCGUGAU -58
Get sequence
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