MirGeneDB ID | Mom-Mir-1986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1986 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGAUUUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mossy chiton (Mopalia muscosa) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Agr-Mir-1986 Cte-Mir-1986 Eba-Mir-1986 Efe-Mir-1986 Hru-Mir-1986-P1 Hru-Mir-1986-P2 Lan-Mir-1986 Lgi-Mir-1986 Lhy-Mir-1986 Mgi-Mir-1986 Npo-Mir-1986 Obi-Mir-1986 Ofu-Mir-1986 Ovu-Mir-1986 Pdu-Mir-1986 Pve-Mir-1986-P3 Pve-Mir-1986-P4 Pve-Mir-1986-P5 Rph-Mir-1986 War-Mir-1986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_031763545.1_ASM3176354v1_genomic_Mom) |
JARFOD010000001.1: 446832-446889 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAUCGGCUGGGAGACUCGGGGUUUUGUGUUCGUGGGUCUUGGGAGGGCCGCCUCUAGCUUGACCAGUGGAUUUCCCAUGAUCCAUGAAUACCAAACACCCACAAACAUCCUUCCAGAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CAUCGGCUGGGAGACUC- -| U U G CUCUAG GGG GUUU GUGUUCGUGGGUC UGGGAGG CCGC C CCC CAAA CAUAAGUACCUAG ACCCUUU GGUG U GAGACCUUCCUACAAACA A^ C U A ACCAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mom-Mir-1986_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGUGGGUCUUGGGAGGGCCGCC -22
Get sequence
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Mature sequence | Mom-Mir-1986_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- UGGAUUUCCCAUGAUCCAUGAA -58
Get sequence
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