| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-1912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1912 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACAGAAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-1912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1912 Cfa-Mir-1912 Cja-Mir-1912 Cpo-Mir-1912 Eca-Mir-1912 Ete-Mir-1912 Hsa-Mir-1912 Laf-Mir-1912 Mml-Mir-1912 Mmr-Mir-1912 Ocu-Mir-1912 Pab-Mir-1912 Rno-Mir-1912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chrX: 147009456-147009514 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1912) |
Mir-1912
chrX: 147009456-147009514 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1264 chrX: 147010614-147010676 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAUAUCACAAGCAUAUUAGUCUCUAGGAUGUGCUCAUUGCAUGGGCUGUGUAGAUUUUUAUUUAAUACACAGAACAUGCAGUGAGAACUUGAUAGAGAUUGGAAGACAUCCAGAAGAAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CAUAUCACAAGCAUAUU--| GGAU G GG GAUUUU AGUCUCUA GU CUCAUUGCAUG CUGUGUA \ UUAGAGAU CA GAGUGACGUAC GACACAU U UAAGAAGACCUACAGAAGG^ AGUU A AA AAUUUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-1912_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGCUCAUUGCAUGGGCUGUGUA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1912-5p miRDB: MIMAT0014957 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-1912_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0014958 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CACAGAACAUGCAGUGAGAACU -59
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1912-3p miRDB: MIMAT0014958 |
