| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-490 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AACCUGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-490 Ami-Mir-490 Bta-Mir-490 Cfa-Mir-490 Cja-Mir-490 Cli-Mir-490 Cpi-Mir-490 Cpo-Mir-490 Dno-Mir-490 Eca-Mir-490 Ete-Mir-490 Gga-Mir-490 Gja-Mir-490 Hsa-Mir-490 Laf-Mir-490 Mdo-Mir-490 Mml-Mir-490 Mmr-Mir-490 Neu-Mir-490 Oan-Mir-490 Ocu-Mir-490 Pab-Mir-490 Pbv-Mir-490 Rno-Mir-490 Sha-Mir-490 Spt-Mir-490 Tgu-Mir-490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Amniota | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Amniota | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr6: 36421763-36421822 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGCUGAUUUGGAAAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAUAUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAAGCAGCGGAACUUCUAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UGGCUGAUUUGGAAAGUUCAUU--- C --| G CACGUUU GUUCGACA CAUGGA UCUCCAGGU GGU \ CGAGUUGU GUACCU GGAGGUCCA CCA A AAUCUUCAAGGCGACGAACACUUGU C CA^ A CAUAUAG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-490_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAUGGAUCUCCAGGUGGGU -20
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-490-5p miRDB: MIMAT0017261 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-490_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0003780 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CAACCUGGAGGACUCCAUGCUGU -60
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003780 TargetScanVert: mmu-miR-490-3p miRDB: MIMAT0003780 |
