MirGeneDB ID | Mun-Mir-223 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-223 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUCAGUU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-223 Ami-Mir-223 Bta-Mir-223 Cfa-Mir-223 Cja-Mir-223 Cli-Mir-223 Cmi-Mir-223 Cpi-Mir-223 Cpo-Mir-223 Dno-Mir-223 Dre-Mir-223 Ebu-Mir-223 Eca-Mir-223 Ete-Mir-223 Gga-Mir-223 Gja-Mir-223 Gmo-Mir-223 Hsa-Mir-223-v1 Hsa-Mir-223-v2 Laf-Mir-223 Lch-Mir-223 Loc-Mir-223 Mal-Mir-223 Mdo-Mir-223 Mml-Mir-223 Mmr-Mir-223 Mmu-Mir-223 Neu-Mir-223 Oan-Mir-223 Ocu-Mir-223 Pab-Mir-223 Pbv-Mir-223 Pma-Mir-223 Rno-Mir-223 Sha-Mir-223 Spt-Mir-223 Sto-Mir-223 Tgu-Mir-223 Tni-Mir-223 Xla-Mir-223 Xtr-Mir-223 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Mun_miRNA_loci) |
223_LR594638.1:10404916-10405051: 36-101 [-] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACGUGGACAUCUGGGCACGGCGUUGCGCUCCGUAUAUUUGAUAAGCUGAAUUUGACACUCAUUUGUGGUAGAGUGUCAGUUUAUCAAAUAUUCUAAGCGAGGCGUCUGAUCAGCAGCCACACUACCGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 ACGUGGACAUCUGGGCAC-- UG CCGU -| GACACUCA GGCGU CGCU AUAUUUGAUAAGCUGA AUUU \ CUGCG GCGA UAUAAACUAUUUGACU UGAG U CCAUCACACCGACGACUAGU GA AUCU G^ AUGGUGUU 120 110 100 90 80 70 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mun-Mir-223_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGUAUAUUUGAUAAGCUGAAUUU -23
Get sequence
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Mature sequence | Mun-Mir-223_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- UGUCAGUUUAUCAAAUAUUCUAA -66
Get sequence
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