| MirGeneDB ID | Tni-Mir-460-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-460 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCUCAUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Pufferfish (Tetraodon nigroviridis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Tni-Mir-460-P1 Tni-Mir-460-P2a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-460-P2 Ami-Mir-460-P2 Cli-Mir-460-P2 Cpi-Mir-460-P2 Dre-Mir-460-P2 Gga-Mir-460-P2 Gja-Mir-460-P2 Gmo-Mir-460-P2 Lch-Mir-460-P2 Loc-Mir-460-P2 Mal-Mir-460-P2 Mun-Mir-460-P2 Spt-Mir-460-P2 Tgu-Mir-460-P2 Xtr-Mir-460-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | T. nigroviridis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Tetraodon_nigroviridis.TETRAODON8.dna.toplevel) |
Un_random: 36284986-36285045 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGCCCCCGCUGAGACCGGUGUGCGGCGGCCUCCUCAUUGUGCAUGCUGUGUGCGCUCCUGUGUCCCACACAGCGUCCUGCAAUGUGGAGGUCGAGGCACAAGCCGACGCCCCGCCCACGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GGCCCCCGCUGAGACCGG-- GG U GC-| CGCUCC UGUGC CGGCCUCC CAUUGU AUGCUGUGUG \ ACACG GCUGGAGG GUAACG UGCGACACAC U CGCACCCGCCCCGCAGCCGA GA U UCC^ CCUGUG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Tni-Mir-460-P2b_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCCUCAUUGUGCAUGCUGUGUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Tni-Mir-460-P2b_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CACAGCGUCCUGCAAUGUGGAGG -60
Get sequence
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