MirGeneDB ID | Aca-Mir-383-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-383 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAUCAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Green anole lizard (Anolis carolinensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aca-mir-383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Aca-Mir-383-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-383-v1 Bta-Mir-383-v1 Cfa-Mir-383-v1 Cli-Mir-383-v1 Cpi-Mir-383-v1 Cpo-Mir-383-v1 Dno-Mir-383-v1 Ete-Mir-383-v1 Gga-Mir-383-v1 Gja-Mir-383-v1 Hsa-Mir-383-v1 Mdo-Mir-383-v1 Mml-Mir-383-v1 Mmu-Mir-383-v1 Mun-Mir-383 Oan-Mir-383-v1 Ocu-Mir-383-v1 Pbv-Mir-383-v1 Rno-Mir-383-v1 Sha-Mir-383-v1 Spt-Mir-383 Tgu-Mir-383-v1 Xtr-Mir-383-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Tetrapoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Tetrapoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (anoCar2) |
5: 106709396-106709457 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-383-v1) |
Mir-383-v1
5: 106709396-106709457 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-383-v2 5: 106709396-106709458 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUGGGAGACCCCUCAAGUCACCUGCUCCUCAGAUCAGAAGGUGAUUGUGGCUUUGCUUUUAUAUGAAACAGCCACAGCACUGCCUGGUCAGAAAGAGCAAGUGUACUAGCCUUUUGCCUCAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CUGGGAGACCCCUCAAGU- C C-| A AA A UUGCUUUU CAC UGCUC UC GAUCAG GGUG UUGUGGCU \ GUG ACGAG AG CUGGUC UCAC GACACCGA A UACUCCGUUUUCCGAUCAU A AA^ A CG - CAAAGUAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Aca-Mir-383-v1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0021952 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGAUCAGAAGGUGAUUGUGGCU -22
Get sequence
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Star sequence | Aca-Mir-383-v1_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0021953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- CCACAGCACUGCCUGGUCAGA -62
Get sequence
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