| MirGeneDB ID | Eba-Mir-1994-P1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1994 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGACAG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Epimenia (Solenogaster) (Epimenia babai) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Eba-Mir-1994-P2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-1994-P1 Cte-Mir-1994 Dgr-Mir-1994 Efe-Mir-1994 Esc-Mir-1994-P1 Hru-Mir-1994-P1 Lan-Mir-1994-o1a Lan-Mir-1994-o1b Lgi-Mir-1994-P1 Lhy-Mir-1994-P1 Llo-Mir-1994 Mgi-Mir-1994-P1 Mom-Mir-1994-P1 Npo-Mir-1994-P1 Obi-Mir-1994-P1 Ovu-Mir-1994-P1 Pve-Mir-1994-P1 Rph-Mir-1994-P1 War-Mir-1994-P1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Mollusca | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Lophotrochozoa | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011762755.2_ASM1176275v2_Epimenia) |
WURV02115877.1: 3888-3946 [-] Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAUUUCGCCAAAUGCUUUAGACUUGUGUAAAGGGAGAACAUUCUGCUCGGCAUGUGCAUUUUGGUCAUGAGACAGUGUGUCCUCCCUUUAGACGAUCAAAAACGCAGCUCGAAGGUGUCGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CAUUUCGCCAAAUGCUUUA---| C G A U - GCAUGUGC GA UUGU UAAAGGGAG ACAU CUG CUCG A CU AGCA AUUUCCCUC UGUG GAC GAGU U CUGUGGAAGCUCGACGCAAAAA^ - G C U A ACUGGUUU 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Eba-Mir-1994-P1_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGGAGAACAUUCUGCUCGGC -21
Get sequence
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| Mature sequence | Eba-Mir-1994-P1_3p |
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| mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UGAGACAGUGUGUCCUCCCUUU -59
Get sequence
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