| MirGeneDB ID | Hme-Mir-9-P12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-9 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAAAGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Longwing butterfly (Heliconius melpomene) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | hme-mir-79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Hme-Mir-9-P9 Hme-Mir-9-P10 Hme-Mir-9-P11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-9-P12-v1 Aae-Mir-9-P12-v2 Aga-Mir-9-P12 Agr-Mir-9 Bfl-Mir-9 Bge-Mir-9-P12-v1 Bge-Mir-9-P12-v2 Bko-Mir-9 Bla-Mir-9 Bpl-Mir-9 Cin-Mir-9 Cte-Mir-9 Dan-Mir-9-P12-v1 Dan-Mir-9-P12-v2 Dgr-Mir-9 Dlo-Mir-9-P12-v1 Dlo-Mir-9-P12-v2 Dme-Mir-9-P12-v1 Dme-Mir-9-P12-v2 Dmo-Mir-9-P12-v1 Dmo-Mir-9-P12-v2 Dsi-Mir-9-P12-v1 Dsi-Mir-9-P12-v2 Dya-Mir-9-P12-v1 Dya-Mir-9-P12-v2 Eba-Mir-9 Egr-Mir-9 Esc-Mir-9 Gpa-Mir-9-P12-v1 Gpa-Mir-9-P12-v2 Gsa-Mir-9 Gsp-Mir-9 Hmi-Mir-9 Hru-Mir-9 Isc-Mir-9 Lan-Mir-9 Lgi-Mir-9 Llo-Mir-9 Mom-Mir-9 Npo-Mir-9 Obi-Mir-9 Ofu-Mir-9 Ovu-Mir-9 Pau-Mir-9 Pdu-Mir-9 Pmi-Mir-9 Pve-Mir-9 Rph-Mir-9 Sma-Mir-9 Snu-Mir-9 Spu-Mir-9 Tca-Mir-9-P12 War-Mir-9 Xbo-Mir-9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Hmel_1) |
HE669612: 9693-9752 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-9-P12) |
Mir-9-P12
HE669612: 9693-9752 [-]
Ensembl
Mir-306 HE669612: 9837-9892 [-] Ensembl Mir-9-P11 HE669612: 10319-10377 [-] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACGUGACUCGACGCGACGCACGAUGCGACGCUUUGGCGAUUUAGCUCCAUGACGUUGCGUGUAUGCUCAUAAAGCUAGAUUACCAAAGCAUCGCGUCGAUGCAAAUAUCAUCAGAAGACAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 ACGUGACUCGACGCGAC- -| C CG CC CGUUGC GCA CGAUGCGA GCUUUGG AUUUAGCU AUGA G CGU GCUGCGCU CGAAACC UAGAUCGA UACU U ACAGAAGACUACUAUAAA A^ A AU AA CGUAUG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Hme-Mir-9-P12_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUUUGGCGAUUUAGCUCCAUGA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Hme-Mir-9-P12_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0024987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AUAAAGCUAGAUUACCAAAGCA -60
Get sequence
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