| MirGeneDB ID | Lpo-Mir-315-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-315 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUUGAUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Lpo-Mir-315-P3 Lpo-Mir-315-P5 Lpo-Mir-315-P6-v1 Lpo-Mir-315-P6-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-315 Bge-Mir-315 Bpl-Mir-315 Cbr-Mir-315 Cel-Mir-315 Csc-Mir-315 Cte-Mir-315 Dan-Mir-315 Dma-Mir-315 Dme-Mir-315 Dmo-Mir-315 Dpu-Mir-315 Dsi-Mir-315 Dya-Mir-315 Efe-Mir-315 Esc-Mir-315 Isc-Mir-315 Lan-Mir-315 Lgi-Mir-315 Npo-Mir-315 Obi-Mir-315 Ovu-Mir-315 Pfl-Mir-315 Pma-Mir-315 Sko-Mir-315 Sme-Mir-315 Tca-Mir-315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | L. polyphemus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000517525.1_Limulus_polyphemus-2.1.2_genomic) |
NW_013677027.1: 9820-9877 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAAGCUAUUAUUGUUAUUUGUCUUCUCGCCUUUUGAUUGUUGCUCAGAAGGCGUGGACUUGACAGGCUUUCGAGCAGCGAUCAAACGCUGAGGAGAUCUGAUACCACAAGUUUAUCUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GAAGCUAUUAUUGUUAUUU-- -| CU A GUGGAC GUCUUCUC GC UUUGAUUGUUGCUC GAAGGC \ UAGAGGAG CG AAACUAGCGACGAG CUUUCG U CUCUAUUUGAACACCAUAGUC U^ C- - GACAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Lpo-Mir-315-P4_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUUGAUUGUUGCUCAGAAGGCG -23
Get sequence
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| Star sequence | Lpo-Mir-315-P4_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CUUUCGAGCAGCGAUCAAACGC -58
Get sequence
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