| MirGeneDB ID | Pve-Mir-1994-P2a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1994 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Vernerds tusk shell (Pictodentalium vernedei) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Pve-Mir-1994-P1 Pve-Mir-1994-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-1994-P2 Cte-Mir-1994 Dgr-Mir-1994 Eba-Mir-1994-P2 Efe-Mir-1994 Esc-Mir-1994-P2 Hru-Mir-1994-P2 Lan-Mir-1994-o2a Lgi-Mir-1994-P2 Llo-Mir-1994 Mgi-Mir-1994-P2 Mom-Mir-1994-P2 Npo-Mir-1994-P2 Obi-Mir-1994-P2 Ovu-Mir-1994-P2 Rph-Mir-1994-P2 War-Mir-1994-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Dentaliidae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (PVE_manual_microRNAloci) |
CM062290.1:123318360-123318615: 101-156 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAUUAGCUUCAUAUUUCAGUCUAUUGUCUAAGGUAGUACAGCCUGUCUGCAUGUUCGUCUACCAUGAGACAGUGUGUCCUCCCUAAGAUUAUGUGACAUUUUCACCAGUUUCUGUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GAUUAGCUUCAUAUUUCA- -| U A U U GC G UUCG GUC UAU GUCU AGG AG ACA CUGUCU CAUG \ CAG GUA UAGA UCC UC UGU GACAGA GUAC U CUGUCUUUGACCACUUUUA U^ U A C C GU - CAUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pve-Mir-1994-P2a_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGUAGUACAGCCUGUCUGCAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Pve-Mir-1994-P2a_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- UGAGACAGUGUGUCCUCCCUAA -56
Get sequence
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