MirGeneDB ID | Sha-Mir-7371-P25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7371 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACGUUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Sha-Mir-7371-o1 Sha-Mir-7371-o2 Sha-Mir-7371-o3 Sha-Mir-7371-o4-v1 Sha-Mir-7371-o4-v2 Sha-Mir-7371-o13 Sha-Mir-7371-o14 Sha-Mir-7371-o15 Sha-Mir-7371-o16 Sha-Mir-7371-o17 Sha-Mir-7371-o18 Sha-Mir-7371-o19 Sha-Mir-7371-o20 Sha-Mir-7371-o24 Sha-Mir-7371-o25 Sha-Mir-7371-o26 Sha-Mir-7371-o27 Sha-Mir-7371-o28 Sha-Mir-7371-P11d Sha-Mir-7371-P11e Sha-Mir-7371-P12a Sha-Mir-7371-P12b Sha-Mir-7371-P13 Sha-Mir-7371-P15 Sha-Mir-7371-P17 Sha-Mir-7371-P18 Sha-Mir-7371-P19-v1 Sha-Mir-7371-P19-v2 Sha-Mir-7371-P20 Sha-Mir-7371-P28a Sha-Mir-7371-P28b Sha-Mir-7371-P29 Sha-Mir-7371-P39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mdo-Mir-7371-P25 Neu-Mir-7371-P25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (DEVIL_add) |
GL867599.1: 288952-289010 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUAUCCUGCACCAUGCCUUCCAUCUGCCCCAGUUGUACCAGAUGCUCCAUUUUCUAGAUUUUAUGAAACGUUGCAUCUUGUAUAACUGUGGCUACUGGAGAAAAUUCUUCCAGCCUGAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GUAUCCUGCACCAUGCC--| UCU C C UCCAUUUUCUAGA UUCCA GCC CAGUUGUAC AGAUGC \ GAGGU CGG GUCAAUAUG UCUACG U UAGUCCGACCUUCUUAAAA^ CAU U U UUGCAAAGUAUUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Sha-Mir-7371-P25_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGUUGUACCAGAUGCUCCAUUU -22
Get sequence
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Mature sequence | Sha-Mir-7371-P25_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- AACGUUGCAUCUUGUAUAACUGU -59
Get sequence
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