MirGeneDB 3.0
74 microRNA genes with node of origin D. rerio
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Dre-Mir-30-P1o1 dre-mir-30a MIR-30 GUAAACA MIMAT0001803 MIMAT0031951 chr19 4737589 4737653 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o1a dre-mir-430a-1 MIR-430 AAGUGCU None MIMAT0001423 chr10 4493289 4493347 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b1 dre-mir-430a-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28694962 28695020 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b2 dre-mir-430a-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28696703 28696761 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b3 dre-mir-430a-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28699047 28699105 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b4 dre-mir-430a-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28700810 28700868 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b5 dre-mir-430a-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28708442 28708500 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b6 dre-mir-430a-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28706702 28706760 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b7 dre-mir-430a-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28704939 28704997 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b8 dre-mir-430a-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28703199 28703257 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1c dre-mir-430a-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031996 MIMAT0001423 chr4 28701436 28701494 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d1 dre-mir-430a-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031995 MIMAT0001423 chr4 28693846 28693904 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d2 dre-mir-430a-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031997 MIMAT0001423 chr4 28695588 28695646 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d3 dre-mir-430a-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031998 MIMAT0001423 chr4 28697329 28697387 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d4 dre-mir-430a-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031999 MIMAT0001423 chr4 28697933 28697991 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d5 dre-mir-430a-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032000 MIMAT0001423 chr4 28703825 28703883 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d6 dre-mir-430a-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032001 MIMAT0001423 chr4 28709068 28709126 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d7 dre-mir-430a-17 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032002 MIMAT0001423 chr4 28707328 28707386 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e1 dre-mir-430i-1 MIR-430 CCCUCAC MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28699673 28699731 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e2 dre-mir-430i-2 MIR-430 CCCUCAC MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28702062 28702120 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e3 dre-mir-430i-3 MIR-430 CCCUCAC MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28705565 28705623 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a1 dre-mir-430b-1 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28694231 28694289 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a2 dre-mir-430b-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28695382 28695440 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a3 dre-mir-430b-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28695972 28696030 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a4 dre-mir-430b-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28697727 28697785 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a5 dre-mir-430b-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28699467 28699525 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a6 dre-mir-430b-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28700079 28700137 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a7 dre-mir-430b-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28701856 28701914 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a8 dre-mir-430b-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28709466 28709524 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a9 dre-mir-430b-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28707712 28707770 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a10 dre-mir-430b-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28707122 28707180 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a11 dre-mir-430b-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28705971 28706029 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a12 dre-mir-430b-17 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28705359 28705417 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a13 dre-mir-430b-18 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28703619 28703677 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a14 dre-mir-430b-19 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28702468 28702526 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2b dre-mir-430b-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28693640 28693698 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c1 dre-mir-430b-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28697123 28697181 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c2 dre-mir-430b-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28701230 28701288 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c3 dre-mir-430b-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28708862 28708920 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2d1 dre-mir-430b-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28698317 28698375 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2d2 dre-mir-430b-20 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28704209 28704267 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o3a1 dre-mir-430c-1 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28693379 28693437 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a2 dre-mir-430c-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28693983 28694041 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a3 dre-mir-430c-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28695121 28695179 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a4 dre-mir-430c-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28695725 28695783 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a5 dre-mir-430c-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28696862 28696920 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a6 dre-mir-430c-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28697466 28697524 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a7 dre-mir-430c-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28699206 28699264 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a8 dre-mir-430c-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28709205 28709263 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a9 dre-mir-430c-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28708601 28708659 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a10 dre-mir-430c-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28707465 28707523 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a11 dre-mir-430c-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28706861 28706919 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a12 dre-mir-430c-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28705724 28705782 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a13 dre-mir-430c-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28702221 28702279 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a14 dre-mir-430c-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28701595 28701653 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a15 dre-mir-430c-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28700969 28701027 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a16 dre-mir-430c-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28699832 28699890 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3b1 None MIR-430 AAGUGCU None None chr4 28698070 28698128 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3b2 None MIR-430 AAGUGCU None None chr4 28703962 28704020 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-732 dre-mir-732 MIR-732 UCAAAGC None MIMAT0003762 chr9 41682940 41682998 + D. rerio D. rerio No
Dre-Mir-2184-P1a dre-mir-2184 MIR-2184 ACAGUAA MIMAT0011288 None chr10 35654276 35654332 - D. rerio Gnathostomata No 1 1
Dre-Mir-2184-P1b None MIR-2184 ACAGUAA None None LKPD01047922.1 7188 7244 + D. rerio Gnathostomata No 1 1
Dre-Mir-2189 dre-mir-2189 MIR-2189 GAUUGUU None MIMAT0011311 chrUn_KN150127v1 17180 17237 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-2191 dre-mir-2191 MIR-2191 CACACCU None MIMAT0011300 chr23 36790250 36790310 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-7148 dre-mir-7148 MIR-7148 AUGGAAA MIMAT0028206 MIMAT0028207 chr2 57103411 57103473 - D. rerio D. rerio No
Dre-Mir-7149 dre-mir-7149 MIR-7149 UCCAAGU MIMAT0028208 MIMAT0028209 chr23 24074089 24074151 + D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-1 None DRE-NOVEL-1 AUUUUCU None None chr18 15584378 15584438 - D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-2 None DRE-NOVEL-2 UAUGUGU None None chr19 6275796 6275851 - D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-3 None DRE-NOVEL-3 CUGAUCA None None chr17 52860985 52861045 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-4 None DRE-NOVEL-4 CAGGAAU None None chr15 37725346 37725406 - D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-5 None DRE-NOVEL-5 CAUGUCA None None chr9 56359312 56359379 - D. rerio D. rerio No 1 1
Dre-Novel-6 None DRE-NOVEL-6 ACAAGGG None None chr3 26193747 26193808 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-7 None DRE-NOVEL-7 GGGCGAU None None chr22 364003 364066 - D. rerio D. rerio No 1 1
Dre-Novel-8 None DRE-NOVEL-8 AAAUAAU None None chr4 6920268 6920338 + D. rerio D. rerio No 1 1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all