MirGeneDB ID | Cja-Mir-362-P3a-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-362 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUGCACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Cja-Mir-362-P3a-v2 Cja-Mir-362-P4 Cja-Mir-362-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-362-P3a-v1 Bta-Mir-362-P3a-v2 Bta-Mir-362-P3a-v3 Cfa-Mir-362-P3a-v1 Cfa-Mir-362-P3a-v2 Dno-Mir-362-P3a-v1 Dno-Mir-362-P3a-v2 Eca-Mir-362-P3a-v1 Eca-Mir-362-P3a-v2 Hsa-Mir-362-P3a-v1 Hsa-Mir-362-P3a-v2 Mml-Mir-362-P3a-v1 Mml-Mir-362-P3a-v2 Mmr-Mir-362-P3a-v1 Mmr-Mir-362-P3a-v2 Ocu-Mir-362-P3a Pab-Mir-362-P3a-v1 Pab-Mir-362-P3a-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021937.1: 48749996-48750057 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGCAGGGCUUUGUGCUCUGCUCCCCCUCUCUAAUCCUUGCUACCUGGGUGAGAGUGCUGUCUGAAUGCAAUGCACCUGGGCAAGGAUUCUGAGAGCGAGAGCUUCAUCUUCGUGUAGGAUGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GGCAGGGCUUUGUGCUCU-- CCC U-| UAC UG AGAG CUGUC GCUC CUCUC AAUCCUUGC C GGUG UG \ CGAG GAGAG UUAGGAACG G CCAC AC U GGUAGGAUGUGCUUCUACUU AGC UC^ --- GU GUA- GUAAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Cja-Mir-362-P3a-v1_5p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAAUCCUUGCUACCUGGGUGAGAGUG -26
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Cja-Mir-362-P3a-v1_3p (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AAUGCACCUGGGCAAGGAUUCUGA -62
Get sequence
|