MirGeneDB ID | Bta-Mir-362-P3a-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-362 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCCACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cow (Bos taurus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | bta-mir-502b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Bta-Mir-362-P1-v1 Bta-Mir-362-P1-v2 Bta-Mir-362-P3a-v1 Bta-Mir-362-P3a-v3 Bta-Mir-362-P3b-v1 Bta-Mir-362-P3b-v2 Bta-Mir-362-P4 Bta-Mir-362-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-362-P3a-v1 Cfa-Mir-362-P3a-v2 Cja-Mir-362-P3a-v1 Cja-Mir-362-P3a-v2 Dno-Mir-362-P3a-v1 Dno-Mir-362-P3a-v2 Eca-Mir-362-P3a-v1 Eca-Mir-362-P3a-v2 Hsa-Mir-362-P3a-v1 Hsa-Mir-362-P3a-v2 Mml-Mir-362-P3a-v1 Mml-Mir-362-P3a-v2 Mmr-Mir-362-P3a-v1 Mmr-Mir-362-P3a-v2 Ocu-Mir-362-P3a Pab-Mir-362-P3a-v1 Pab-Mir-362-P3a-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_002263795.1_ARS-UCD1.2_BTA) |
NC_037357.1: 87736191-87736252 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-362-P3a-v2) |
Mir-188-P1
NC_037357.1: 87724748-87724806 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-188-P2 NC_037357.1: 87725070-87725129 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P1-v1 NC_037357.1: 87732069-87732124 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P1-v2 NC_037357.1: 87732069-87732124 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P3a-v3 NC_037357.1: 87736191-87736252 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P3a-v2 NC_037357.1: 87736191-87736252 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P3a-v1 NC_037357.1: 87736191-87736252 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P4 NC_037357.1: 87736674-87736732 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P3b-v1 NC_037357.1: 87737938-87737999 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P3b-v2 NC_037357.1: 87737938-87737999 [+] UCSC Ensembl Mir-188-P3 NC_037357.1: 87740093-87740151 [+] UCSC Ensembl Mir-362-P6 NC_037357.1: 87742037-87742096 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGUGGGACCGUCUGUUGUGGCUCCCCUCUCUAAUUCUUGCUCCCCAGGUGAGAGUGCUUUGUGAAUGCAAUCCACCUGGGCAAGGAUUCUGAAUGUGAGAGCUCCCAUCUUCCAUAUGGGACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CGUGGGACCGUCUGUUGU- CCCUC- U-| UCC A G UUUG GGCUC UC AAUUCUUGC CCAGGUG GA UGC \ UCGAG AG UUAGGAACG GGUCCAC CU ACG U CAGGGUAUACCUUCUACCC AGUGUA UC^ --- - A UAAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Bta-Mir-362-P3a-v2_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAAUUCUUGCUCCCCAGGUGAGAGUGC -27
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Bta-Mir-362-P3a-v2_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0009339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- AUCCACCUGGGCAAGGAUUCUGA -62
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
TargetScanVert: bta-miR-502b |