MirGeneDB ID | Hsa-Mir-337-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-337 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAAAGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-337-v1 Hsa-Mir-337-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-337 Eca-Mir-337 Eca-Mir-337-as Laf-Mir-337 Mml-Mir-337-as Mmu-Mir-337 Mmu-Mir-337-as Ocu-Mir-337-as Pab-Mir-337 Rno-Mir-337 Rno-Mir-337-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Euarchontoglires | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr14: 100874513-100874572 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-337-as) |
Mir-770
chr14: 100852409-100852470 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-493 chr14: 100869075-100869136 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v1 chr14: 100874515-100874574 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 chr14: 100874515-100874574 [+] UCSC Ensembl Mir-431 chr14: 100881026-100881089 [+] UCSC Ensembl Mir-433 chr14: 100881897-100881970 [+] UCSC Ensembl Mir-127 chr14: 100883001-100883056 [+] UCSC Ensembl Mir-432 chr14: 100884496-100884564 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 chr14: 100884716-100884771 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 chr14: 100884716-100884771 [+] UCSC Ensembl Mir-370 chr14: 100911151-100911207 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCGGGGGCUGCGCGUGGUUGAAGGGGAUGAAGAAAGGCAUCAUAUAGGAGCUGGAUAACUGUGCAUCAACUCCUGUAUGAAGCCGUUCCCACCCCCCAACUACUGACUACGGGCCGCAACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCGGGGGCUGCGCGUGGUUGAA--| A AA A A C GAUAAC GGGG UG GAA GGC UCAUAUAGGAG UG \ CCCC AC CUU CCG AGUAUGUCCUC AC U CAACGCCGGGCAUCAGUCAUCAAC^ C C- G A A UACGUG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-337-as_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGAAAGGCAUCAUAUAGGAGCUG -23
Get sequence
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Co-mature sequence | Hsa-Mir-337-as_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- ACUCCUGUAUGAAGCCGUUCCC -60
Get sequence
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