| MirGeneDB ID | Lan-Mir-1990-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1990 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGGACUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lingula (Lingula anatina) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Lan-Mir-1990-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-1990-P2 Cte-Mir-1990-P2 Cte-Mir-1990-P2-as Eba-Mir-1990-P2 Efe-Mir-1990-P2 Hru-Mir-1990-P2 Lgi-Mir-1990-P2 Mgi-Mir-1990-P2 Mom-Mir-1990-P2 Npo-Mir-1990-P2 Ofu-Mir-1990-P2 Pdu-Mir-1990-P2 Pdu-Mir-1990-P2-as Pve-Mir-1990-P2a1 Pve-Mir-1990-P2a2 Pve-Mir-1990-P2b Pve-Mir-1990-P2c Pve-Mir-1990-P2d Pve-Mir-1990-P2e Rph-Mir-1990-P2 War-Mir-1990-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Lophotrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (LinAna_1.0) |
LFEI01000037: 537538-537595 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGAUGUACACAGACAUAGGAGGUCUCGCGCUGUAAGUUUACAUAGUCCCAGGUUGUGACGGGUUCCCGGGACUAUGUCAACUUCCAGCUUGGCACCCUUCUCAUCACCACGCACAGUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AGAUGUACACAGACAUA- UC-| C U U A UUGUG GGAGG UCG GCUG AAGUU ACAUAGUCCC GG A CUUCC GGU CGAC UUCAA UGUAUCAGGG CC C UUGACACGCACCACUACU CAC^ U C C C UUGGG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lan-Mir-1990-P2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGUAAGUUUACAUAGUCCCAGG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Lan-Mir-1990-P2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CGGGACUAUGUCAACUUCCAGC -58
Get sequence
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