MirGeneDB ID | Mun-Mir-204-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-204 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCCCUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mun-Mir-204-P1 Mun-Mir-204-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-204-P2 Ami-Mir-204-P2 Bta-Mir-204-P2 Cfa-Mir-204-P2 Cja-Mir-204-P2 Cli-Mir-204-P2 Cmi-Mir-204-P2 Cpi-Mir-204-P2 Cpo-Mir-204-P2 Dno-Mir-204-P2 Dre-Mir-204-P2 Ebu-Mir-204 Eca-Mir-204-P2 Ete-Mir-204-P2 Gga-Mir-204-P2 Gja-Mir-204-P2 Gmo-Mir-204-P2 Hsa-Mir-204-P2 Laf-Mir-204-P2 Lch-Mir-204-P2 Loc-Mir-204-P2 Mal-Mir-204-P2 Mdo-Mir-204-P2 Mml-Mir-204-P2 Mmr-Mir-204-P2 Mmu-Mir-204-P2 Neu-Mir-204-P2 Oan-Mir-204-P2 Ocu-Mir-204-P2 Pab-Mir-204-P2 Pbv-Mir-204-P2 Pma-Mir-204 Rno-Mir-204-P2 Sha-Mir-204-P2 Spt-Mir-204-P2 Sto-Mir-204-P2 Tgu-Mir-204-P2 Tni-Mir-204-P2 Xla-Mir-204-P2a Xla-Mir-204-P2b Xtr-Mir-204-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Mun_miRNA_loci) |
204-P2_LR594633.1:243787357-243787498: 42-101 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUACAUUAUUUUUUCAUGUGACCCGUGGGCUUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCUGAAAAUAUAUGAAGGGGGCUGGGAAGGCAAAGGGACGUUCAAUUGUCAUCAUUGGCAUCUUCUUUGAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUACAUUAUUUUUUCAU--| CCG U A U GAAAAUA GUGAC UGGGC UCCCUUUGUC UCCUA GCCU \ UACUG ACUUG AGGGAAACGG AGGGU CGGG U UAGUUUCUUCUACGGUUAC^ UUA C A - GGAAGUA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Mun-Mir-204-P2_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCUG -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Mun-Mir-204-P2_3p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- GGCUGGGAAGGCAAAGGGACGU -60
Get sequence
|