MirGeneDB 3.0
93 microRNA genes with seed UACAGUA
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Aca-Mir-101-P1-v2 aca-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0021710 MIMAT0021711 4 98411455 98411511 + Vertebrata Vertebrata No
Ami-Mir-101-P1-v2 ami-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0038116 MIMAT0038117 NW_017710321.1 12121220 12121276 + Vertebrata Vertebrata No
Bta-Mir-101-P1-v2 bta-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0003520 NC_037330.1 80335450 80335506 + Vertebrata Vertebrata No
Cfa-Mir-101-P1-v2 cfa-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0006600 chr5 45184773 45184829 + Vertebrata Vertebrata No
Cja-Mir-101-P1-v2 None MIR-101 UACAGUA None None CM021921.1 99374273 99374329 - Vertebrata Vertebrata No
Cli-Mir-101-P1-v2 cli-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0038482 MIMAT0038483 scaffold7 15720709 15720765 - Vertebrata Vertebrata No
Cmi-Mir-101-P1-v2 None MIR-101 UACAGUA None None KI635887.1 6427948 6428004 + Vertebrata Vertebrata No 1
Cpi-Mir-101-P1-v2 cpi-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0037716 MIMAT0037717 JH584706 839803 839859 - Vertebrata Vertebrata No
Cpo-Mir-101-P1-v2 cpo-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0046947 MIMAT0046948 scaffold_2 67531173 67531229 + Vertebrata Vertebrata No 1 1
Dno-Mir-101-P1-v2 dno-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0047598 MIMAT0047599 JH582969 1484136 1484192 - Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-101-P1-v2 dre-mir-101a MIR-101 UACAGUA None MIMAT0001814 chr6 31365459 31365515 + Vertebrata Vertebrata No
Eca-Mir-101-P1-v2 eca-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0012951 CM009152.1 92613113 92613169 + Vertebrata Vertebrata No
Ete-Mir-101-P1-v2 None MIR-101 UACAGUA None None JH980298 60204640 60204696 + Vertebrata Vertebrata No
Gga-Mir-101-P1-v2 gga-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0031077 MIMAT0001185 8 28612657 28612713 - Vertebrata Vertebrata No
Gja-Mir-101-P1-v2 None MIR-101 UACAGUA None None NW_015177048.1 96035 96091 + Vertebrata Vertebrata No
Gmo-Mir-101-P1-v2 gmo-mir-101a MIR-101 UACAGUA MIMAT0044119 MIMAT0044120 GeneScaffold_1472 99850 99906 - Vertebrata Vertebrata No
Hsa-Mir-101-P1-v2 hsa-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0004513 MIMAT0000099 chr1 65058442 65058498 - Vertebrata Vertebrata No
Laf-Mir-101-P1-v2 None MIR-101 UACAGUA None None GL010044.1 29122929 29122985 + Vertebrata Vertebrata No
Loc-Mir-101-P1-v2 None MIR-101 UACAGUA None None LG10 10266779 10266835 - Vertebrata Vertebrata No
Mal-Mir-101-P1-v2 None MIR-101 UACAGUA None None KV884746.1 1742490 1742546 - Vertebrata Vertebrata No
Mdo-Mir-101-P1-v2 mdo-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0031076 MIMAT0004098 2 26267876 26267932 + Vertebrata Vertebrata No
Mml-Mir-101-P1-v2 mml-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0026581 MIMAT0002431 CM014336.1 159372687 159372743 + Vertebrata Vertebrata No
Mmr-Mir-101-P1-v2 mmr-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0049165 CM007662.1 1257473 1257529 - Vertebrata Vertebrata No
Mmu-Mir-101-P1-v2 mmu-mir-101a MIR-101 UACAGUA MIMAT0004526 MIMAT0000133 chr4 101346957 101347013 - Vertebrata Vertebrata No
Mun-Mir-101-P1-v2 None MIR-101 UACAGUA None None 101-P1-v1_LR594637.1:42114281-42114423 44 100 - Vertebrata Vertebrata No
Oan-Mir-101-P1-v2 oan-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0007011 NC_041745.1 41083107 41083163 + Vertebrata Vertebrata No 1
Ocu-Mir-101-P1-v2 ocu-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0048186 MIMAT0048187 chr13 101340539 101340595 + Vertebrata Vertebrata No 1
Pab-Mir-101-P1-v2 None MIR-101 UACAGUA None None CM054679.2 168068140 168068196 + Vertebrata Vertebrata No
Pbv-Mir-101-P1-v2 pbv-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0038901 MIMAT0038902 KE954279.1 114045 114101 - Vertebrata Vertebrata No
Rno-Mir-101-P1-v2 rno-mir-101a MIR-101 UACAGUA MIMAT0004726 MIMAT0000823 chr5 120168445 120168501 - Vertebrata Vertebrata No
Sha-Mir-101-P1-v2 sha-mir-101 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0022811 GL856736.1 1265482 1265538 + Vertebrata Vertebrata No 1
Sto-Mir-101-P1-v2 None MIR-101 UACAGUA None None BFAA01000061.1 1365252 1365308 - Vertebrata Vertebrata No 1
Tgu-Mir-101-P1-v2 tgu-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0014631 MIMAT0014508 8 1553621 1553677 + Vertebrata Vertebrata No
Tni-Mir-101-P1-v2 tni-mir-101a MIR-101 UACAGUA None MIMAT0002903 1 20355622 20355678 + Vertebrata Vertebrata No
Xtr-Mir-101-P1-v2 xtr-mir-101a-2 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0003662 chr4 79102564 79102620 - Vertebrata Vertebrata No
Xla-Mir-101-P1a-v2 None MIR-101 UACAGUA None None NC_030730.1 73858578 73858634 + X. laevis Vertebrata No
Xla-Mir-101-P1b-v2 None MIR-101 UACAGUA None None NC_030731.1 58882294 58882350 + X. laevis Vertebrata No
Aca-Mir-101-P2-v2 aca-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0021712 MIMAT0021711 2 52137658 52137714 + Vertebrata Vertebrata No
Ami-Mir-101-P2-v2 ami-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0038118 MIMAT0038117 NW_017713772.1 32263712 32263768 + Vertebrata Vertebrata No
Bta-Mir-101-P2-v2 bta-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0003520 NC_037335.1 39689039 39689095 - Vertebrata Vertebrata No
Cfa-Mir-101-P2-v2 cfa-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0006600 chr1 93194327 93194383 + Vertebrata Vertebrata No
Cja-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None CM021915.1 108313219 108313275 + Vertebrata Vertebrata No
Cli-Mir-101-P2-v2 cli-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0038484 MIMAT0038483 scaffold6 3523035 3523091 - Vertebrata Vertebrata No
Cmi-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None KI635975.1 375731 375786 - Vertebrata Vertebrata No
Cpi-Mir-101-P2-v2 cpi-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0037718 MIMAT0037717 JH584680 13719007 13719063 + Vertebrata Vertebrata No
Cpo-Mir-101-P2-v2 cpo-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0046949 MIMAT0046948 scaffold_21 15000496 15000552 - Vertebrata Vertebrata No
Dno-Mir-101-P2-v2 dno-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0047600 MIMAT0047599 JH567481 2307392 2307448 - Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-101-P2-v2 dre-mir-101b MIR-101 UACAGUA None MIMAT0001815 chr5 1837177 1837233 - Vertebrata Vertebrata No 1 1
Eca-Mir-101-P2-v2 eca-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0012951 CM009170.1 25728399 25728455 + Vertebrata Vertebrata No
Ete-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None JH980382 6713737 6713793 + Vertebrata Vertebrata No 1
Gga-Mir-101-P2-v2 gga-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0026545 MIMAT0001185 Z 27510599 27510655 + Vertebrata Vertebrata No
Gja-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None NW_015163623.1 608903 608959 - Vertebrata Vertebrata No
Gmo-Mir-101-P2-v2 gmo-mir-101b MIR-101 UACAGUA MIMAT0044231 MIMAT0044232 GeneScaffold_3576 29660 29716 + Vertebrata Vertebrata No 1
Hsa-Mir-101-P2-v2 hsa-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0037312 MIMAT0000099 chr9 4850309 4850365 + Vertebrata Vertebrata No
Laf-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None GL010115.1 848350 848406 - Vertebrata Vertebrata No
Loc-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None LG2 37364266 37364322 - Vertebrata Vertebrata No
Mal-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None KV884763.1 1469812 1469868 + Vertebrata Vertebrata No 1
Mdo-Mir-101-P2-v2 mdo-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0026657 MIMAT0004098 6 166669178 166669234 + Vertebrata Vertebrata No
Mml-Mir-101-P2-v2 mml-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0031100 MIMAT0002431 CM014350.1 78991108 78991164 - Vertebrata Vertebrata No
Mmr-Mir-101-P2-v2 mmr-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0049165 CM007670.1 26908065 26908121 - Vertebrata Vertebrata No
Mmu-Mir-101-P2-v2 mmu-mir-101b MIR-101 UACAGUA MIMAT0017046 MIMAT0000616 chr19 29135303 29135359 + Vertebrata Vertebrata No
Mun-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None 101-P2-v1_LR594633.1:234314504-234314646 44 100 - Vertebrata Vertebrata No 1
Neu-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None CM051813.1 39793867 39793923 - Vertebrata Vertebrata No
Oan-Mir-101-P2-v2 oan-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0007011 NC_041753.1 52495167 52495223 - Vertebrata Vertebrata No
Ocu-Mir-101-P2-v2 ocu-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0048188 MIMAT0048187 chr1 49384672 49384728 - Vertebrata Vertebrata No
Pab-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None CM054692.2 53818389 53818445 - Vertebrata Vertebrata No
Pbv-Mir-101-P2-v2 pbv-mir-101-2 MIR-101 UACAGUA MIMAT0038903 MIMAT0038902 KE954797.1 126582 126638 - Vertebrata Vertebrata No
Rno-Mir-101-P2-v2 rno-mir-101b MIR-101 UACAGUA MIMAT0017045 MIMAT0000615 chr1 247263747 247263803 + Vertebrata Vertebrata No
Sha-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None GL841562.1 1424391 1424447 + Vertebrata Vertebrata No
Sto-Mir-101-P2-v2 None MIR-101 UACAGUA None None BFAA01004869.1 93867 93923 + Vertebrata Vertebrata No
Tgu-Mir-101-P2-v2 tgu-mir-101-1 MIR-101 UACAGUA MIMAT0031101 MIMAT0014508 Z 68899073 68899129 + Vertebrata Vertebrata No
Tni-Mir-101-P2-v2 tni-mir-101b MIR-101 UACAGUA None MIMAT0003040 4 1028861 1028917 + Vertebrata Vertebrata No 1
Xtr-Mir-101-P2-v2 xtr-mir-101a-1 MIR-101 UACAGUA None MIMAT0003662 chr1 115031352 115031408 - Vertebrata Vertebrata No 1
Xla-Mir-101-P2a-v2 xla-mir-101 MIR-101 UACAGUA MIMAT0046412 MIMAT0046413 NC_030724.1 125355860 125355916 - X. laevis Vertebrata No
Xla-Mir-101-P2b-v2 None MIR-101 UACAGUA None None NW_016694889.1 314987 315043 - X. laevis Vertebrata No 1
Ete-Mir-144 None MIR-144 GAUAUCA None None JH980319 4842438 4842495 + Vertebrata Vertebrata No
Laf-Mir-144 None MIR-144 GAUAUCA None None GL010074.1 1839018 1839075 - Vertebrata Vertebrata No
Lch-Mir-144 None MIR-144 UACAGUA None None JH127350.1 728206 728264 - Vertebrata Vertebrata Unknown
Pbv-Mir-144 pbv-mir-144 MIR-144 UACAGUA MIMAT0038957 MIMAT0038958 KE957536.1 98855 98911 - Vertebrata Vertebrata No 1 1
Spt-Mir-144 None MIR-144 GAUAUCA None None QEPC01008384.1 2358679 2358736 + Vertebrata Vertebrata Unknown 1
Aca-Mir-144-v2 aca-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0021771 MIMAT0021772 G889P68288RO14 342 398 - Vertebrata Vertebrata No
Cli-Mir-144-v2 None MIR-144 GAUAUCA None None SRR516967 48 105 + Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-144-v2 dre-mir-144 MIR-144 UACAGUA MIMAT0031975 MIMAT0001841 chr5 42272092 42272150 - Vertebrata Vertebrata No 1
Ebu-Mir-144-v2 None MIR-144 UACAGUA None None FYBX02009908.1 8547203 8547259 - Vertebrata Vertebrata No
Gja-Mir-144-v2 None MIR-144 UACAGUA None None NW_015173122.1 2276609 2276665 - Vertebrata Vertebrata No 1
Gmo-Mir-144-v2 gmo-mir-144 MIR-144 UACAGUA MIMAT0044027 MIMAT0044028 contig314418 343 401 + Vertebrata Vertebrata No 1
Hsa-Mir-144-v2 hsa-mir-144 MIR-144 UACAGUA MIMAT0004600 MIMAT0000436 chr17 28861547 28861604 - Vertebrata Vertebrata No 1
Loc-Mir-144-v2 None MIR-144 UACAGUA None None LG22 3766309 3766367 + Vertebrata Vertebrata No 1
Mal-Mir-144-v2 None MIR-144 GAUAUCA None None KV884735.1 275834 275892 + Vertebrata Vertebrata No 1
Mun-Mir-144-v2 None MIR-144 GAUAUCA None None 144-v1_LR594644.1:58948985-58949242 101 158 + Vertebrata Vertebrata No
Tgu-Mir-144-v2 tgu-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0014650 MIMAT0014596 19 4217046 4217103 + Vertebrata Vertebrata No 1
Xla-Mir-144-P1-v1 None MIR-144 GAUAUCA None None NC_030726.1 32856364 32856421 + X. laevis Vertebrata No 1 1
Xla-Mir-144-P2-v1 xla-mir-144 MIR-144 GAUAUCA MIMAT0046458 MIMAT0046459 NC_030727.1 4344085 4344142 - X. laevis Vertebrata No 1 1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all