MirGeneDB ID | Hsa-Mir-144-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-144 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UACAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-144 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-144-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-144-v2 Ami-Mir-144 Bta-Mir-144-v2 Cfa-Mir-144-v2 Cja-Mir-144-v2 Cli-Mir-144-v2 Cmi-Mir-144 Cpi-Mir-144 Cpo-Mir-144-v2 Dno-Mir-144 Dre-Mir-144-v2 Ebu-Mir-144-v2 Eca-Mir-144-v2 Ete-Mir-144 Gga-Mir-144 Gja-Mir-144-v2 Gmo-Mir-144-v2 Laf-Mir-144 Lch-Mir-144 Loc-Mir-144-v2 Mal-Mir-144-v2 Mdo-Mir-144 Mml-Mir-144 Mmr-Mir-144 Mmu-Mir-144-v2 Mun-Mir-144-v2 Neu-Mir-144-v2 Oan-Mir-144 Ocu-Mir-144-v2 Pab-Mir-144-v2 Pbv-Mir-144 Pma-Mir-144 Rno-Mir-144-v2 Sha-Mir-144 Spt-Mir-144 Sto-Mir-144 Tgu-Mir-144-v2 Tni-Mir-144 Xtr-Mir-144 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr17: 28861547-28861604 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-144-v2) |
Mir-451
chr17: 28861383-28861424 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-144-v1 chr17: 28861547-28861604 [-] UCSC Ensembl Mir-144-v2 chr17: 28861547-28861604 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUUCCUGUGCCCCCAGUGGGGCCCUGGCUGGGAUAUCAUCAUAUACUGUAAGUUUGCGAUGAGACACUACAGUAUAGAUGAUGUACUAGUCCGGGCACCCCCAGCUCUGGAGCCUGACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CUUCCUGUGCCCCCAGU- -| U G A A UUGCG GGG GCCC GGCUGG AUAUCAUC UAUACUGUA GU A CCC CGGG CUGAUC UGUAGUAG AUAUGACAU CA U CAGUCCGAGGUCUCGACC A^ C A - - CAGAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Hsa-Mir-144-v2_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0004600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GGAUAUCAUCAUAUACUGUAAGU -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004600 TargetScanVert: hsa-miR-144-5p TargetMiner: hsa-miR-144-5p miRDB: MIMAT0004600 |
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Mature sequence | Hsa-Mir-144-v2_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000436 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CUACAGUAUAGAUGAUGUACUA -58
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000436 TargetScanVert: hsa-miR-144-3p TargetMiner: hsa-miR-144-3p miRDB: MIMAT0000436 |