| MirGeneDB ID | Lpo-Mir-76-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-76 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCGUUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Lpo-Mir-76-P3 Lpo-Mir-76-P5 Lpo-Mir-76-P6 Lpo-Mir-76-P7 Lpo-Mir-76-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-76 Asu-Mir-76 Bge-Mir-76 Bpl-Mir-76 Cbr-Mir-76 Cel-Mir-76 Cgi-Mir-76 Cte-Mir-76 Dan-Mir-76 Dma-Mir-76 Dme-Mir-76 Dmo-Mir-76 Dpu-Mir-76 Dsi-Mir-76 Dya-Mir-76 Efe-Mir-76 Esc-Mir-76 Hme-Mir-76 Isc-Mir-76 Lgi-Mir-76 Npo-Mir-76 Obi-Mir-76 Ovu-Mir-76 Pmi-Mir-76 Spu-Mir-76 Tca-Mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | L. polyphemus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000517525.1_Limulus_polyphemus-2.1.2_genomic) |
NW_013665723.1: 137690-137751 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGCAGCAUGAAAUCGAGAGGAGAUAUUGUACAGGUUUCUCGAUUAGCGAACAAACAUCGUUAUUUAAAUGUUCGUUGUCGUUGAAACCUGAACGAAACUUCUCAUGCCAACCAGAUCCCAUAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AGCAGCAUGAAAUCGAGAG UA-- A U-| U AACAUCG GAGA UUGU CAGGUUUC CGAU AGCGAACA U CUCU AGCA GUCCAAAG GCUG UUGCUUGU U AUACCCUAGACCAACCGUA UCAA A UU^ - AAAUUUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lpo-Mir-76-P4_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAGGUUUCUCGAUUAGCGAACA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Lpo-Mir-76-P4_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UUCGUUGUCGUUGAAACCUGAA -62
Get sequence
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