MirGeneDB ID | Snu-Mir-76 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-76 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCGUUGU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Peanut worm (Sipunculus nudus) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-76 Aga-Mir-76 Agr-Mir-76 Asu-Mir-76 Ava-Mir-76-P11 Ava-Mir-76-P12 Bge-Mir-76 Bko-Mir-76 Bpl-Mir-76 Cbr-Mir-76 Cel-Mir-76 Csc-Mir-76-P10a Csc-Mir-76-P10b Cte-Mir-76 Dan-Mir-76 Dgr-Mir-76 Dlo-Mir-76 Dma-Mir-76 Dme-Mir-76 Dmo-Mir-76 Dpu-Mir-76 Dsi-Mir-76 Dya-Mir-76 Eba-Mir-76 Efe-Mir-76 Esc-Mir-76 Gpa-Mir-76 Gsa-Mir-76 Hme-Mir-76 Hru-Mir-76 Isc-Mir-76 Lan-Mir-76-P1 Lan-Mir-76-P2 Lgi-Mir-76 Llo-Mir-76 Lpo-Mir-76-P3 Lpo-Mir-76-P4 Lpo-Mir-76-P5 Lpo-Mir-76-P6 Lpo-Mir-76-P7 Lpo-Mir-76-P8 Mgi-Mir-76 Mom-Mir-76 Npo-Mir-76 Obi-Mir-76 Ofu-Mir-76 Ovu-Mir-76 Pau-Mir-76 Pcr-Mir-76 Pdu-Mir-76 Pmi-Mir-76 Pve-Mir-76 Rph-Mir-76 Sma-Mir-76 Sme-Mir-76-P9a Sme-Mir-76-P9b Spu-Mir-76 Tca-Mir-76 Tur-Mir-76 War-Mir-76 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Nephrozoa | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Nephrozoa | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_026874595.1_ASM2687459v1_Sipunculus_nudus) |
CM049315.1: 56654353-56654412 [+] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUUGCAUACAGCCGAGAUGGCCAGUGCGGACGGGUUUCGCGAUGAGCGUGCAGUUUUUUAGACUUGUUCGUUGUCGUCGAAACCUGCCUCGGCUGGUCCUGUGGCGCCGAGGGUCACCAGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUUUGCAUACAGCCGAGAU-- -| C A - G U GUUUU GGCCAG UG GG CGGGUUUCG CGAU AGCG GCA U CUGGUC GC CC GUCCAAAGC GCUG UUGC UGU U ACCACUGGGAGCCGCGGUGUC G^ U - U - U UCAGA . 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Snu-Mir-76_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACGGGUUUCGCGAUGAGCGUGCA -23
Get sequence
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Mature sequence | Snu-Mir-76_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UUCGUUGUCGUCGAAACCUGCCU -60
Get sequence
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