| MirGeneDB ID | Spu-Mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-76 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCGUUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Purple sea urchin (Strongylocentrotus purpuratus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | spu-mir-981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-76 Aga-Mir-76 Agr-Mir-76 Asu-Mir-76 Ava-Mir-76-P11 Ava-Mir-76-P12 Bge-Mir-76 Bko-Mir-76 Bpl-Mir-76 Cbr-Mir-76 Cel-Mir-76 Csc-Mir-76-P10a Csc-Mir-76-P10b Cte-Mir-76 Dan-Mir-76 Dgr-Mir-76 Dlo-Mir-76 Dma-Mir-76 Dme-Mir-76 Dmo-Mir-76 Dpu-Mir-76 Dsi-Mir-76 Dya-Mir-76 Eba-Mir-76 Efe-Mir-76 Esc-Mir-76 Gpa-Mir-76 Gsa-Mir-76 Hme-Mir-76 Hru-Mir-76 Isc-Mir-76 Lan-Mir-76-P1 Lan-Mir-76-P2 Lgi-Mir-76 Llo-Mir-76 Lpo-Mir-76-P3 Lpo-Mir-76-P4 Lpo-Mir-76-P5 Lpo-Mir-76-P6 Lpo-Mir-76-P7 Lpo-Mir-76-P8 Mgi-Mir-76 Mom-Mir-76 Npo-Mir-76 Obi-Mir-76 Ofu-Mir-76 Ovu-Mir-76 Pau-Mir-76 Pcr-Mir-76 Pdu-Mir-76 Pmi-Mir-76 Pve-Mir-76 Rph-Mir-76 Sma-Mir-76 Sme-Mir-76-P9a Sme-Mir-76-P9b Snu-Mir-76 Tca-Mir-76 Tur-Mir-76 War-Mir-76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Nephrozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Spur_5.0) |
AAGJ06000011.1: 20172220-20172283 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGUCAUGACAUCACAGAAGGCAUAUUAUCCACGGGUUUCGCUGAUAUCGCACAGUUCUUUUAAUGUCUCUGUUCGUUGUCAACGAAACCUGCGGUUAUUGCCUUGGUUCAGCGAAGUGCAAUCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GGUCAUGACAUCACAGA----| UAUUAU A C U C GUUCUUU AGGCA CC CGGGUUUCG UGAUA CG ACA U UCCGU GG GUCCAAAGC ACUGU GC UGU A UCUAACGUGAAGCGACUUGGU^ UAUU-- C A U U CUCUGUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Spu-Mir-76_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGGGUUUCGCUGAUAUCGCACA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Spu-Mir-76_3p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0020068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- UUCGUUGUCAACGAAACCUGCGG -64
Get sequence
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