| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-128-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-128 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CACAGUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-128-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmu-Mir-128-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-128-P1 Ami-Mir-128-P1 Bta-Mir-128-P1 Cfa-Mir-128-P1 Cja-Mir-128-P1 Cli-Mir-128-P1 Cmi-Mir-128-P1 Cpi-Mir-128-P1 Cpo-Mir-128-P1 Dno-Mir-128-P1 Dre-Mir-128-P1 Ebu-Mir-128 Eca-Mir-128-P1 Ete-Mir-128-P1 Gga-Mir-128-P1 Gja-Mir-128-P1 Gmo-Mir-128-P1 Hsa-Mir-128-P1 Laf-Mir-128-P1 Lch-Mir-128-P1 Loc-Mir-128-P1 Mal-Mir-128-P1 Mdo-Mir-128-P1 Mml-Mir-128-P1 Mmr-Mir-128-P1 Mun-Mir-128-P1 Neu-Mir-128-P1 Oan-Mir-128-P1 Ocu-Mir-128-P1 Pab-Mir-128-P1 Pbv-Mir-128-P1 Pma-Mir-128-o1 Rno-Mir-128-P1 Sha-Mir-128-P1 Spt-Mir-128-P1 Sto-Mir-128-P1 Tgu-Mir-128-P1 Tni-Mir-128-P1 Xla-Mir-128-P1a Xla-Mir-128-P1b Xtr-Mir-128-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr9: 112118644-112118701 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAGCCCCGGCAGCCACUGUGCAGUGGGAAGGGGGGCCGAUGCACUGUAAGAGAGUGAGUAGCAGGUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUCCCUACUGUGUCAAACUCCUAAGGAAUGCCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GAGCCCCGGCAGCCACU--|UG A AUG AA GUGAG G CAGUGGG AGGGGGGCCG CACUGU GAGA U U GUCAUCC UUUCUCUGGC GUGACA CUCU A CCGUAAGGAAUCCUCAAAC^GU C CAA -- GGACG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-128-P1_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017069 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGGGGCCGAUGCACUGUAAGAGA -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-128-2-5p miRDB: MIMAT0017069 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-128-P1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000140 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UCACAGUGAACCGGUCUCUUU -58
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000140 TargetScanVert: mmu-miR-128-3p miRDB: MIMAT0000140 |
