| MirGeneDB ID | Pbv-Mir-128-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-128 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CACAGUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Burmese python (Python bivittatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | pbv-mir-128-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Pbv-Mir-128-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-128-P1 Ami-Mir-128-P1 Bta-Mir-128-P1 Cfa-Mir-128-P1 Cja-Mir-128-P1 Cli-Mir-128-P1 Cmi-Mir-128-P1 Cpi-Mir-128-P1 Cpo-Mir-128-P1 Dno-Mir-128-P1 Dre-Mir-128-P1 Ebu-Mir-128 Eca-Mir-128-P1 Ete-Mir-128-P1 Gga-Mir-128-P1 Gja-Mir-128-P1 Gmo-Mir-128-P1 Hsa-Mir-128-P1 Laf-Mir-128-P1 Lch-Mir-128-P1 Loc-Mir-128-P1 Mal-Mir-128-P1 Mdo-Mir-128-P1 Mml-Mir-128-P1 Mmr-Mir-128-P1 Mmu-Mir-128-P1 Mun-Mir-128-P1 Neu-Mir-128-P1 Oan-Mir-128-P1 Ocu-Mir-128-P1 Pab-Mir-128-P1 Pma-Mir-128-o1 Rno-Mir-128-P1 Sha-Mir-128-P1 Spt-Mir-128-P1 Sto-Mir-128-P1 Tgu-Mir-128-P1 Tni-Mir-128-P1 Xla-Mir-128-P1a Xla-Mir-128-P1b Xtr-Mir-128-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000186305.2_Python_molurus_bivittatus) |
KE953325.1: 123675-123732 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAGGUUCCUGCGGUGAUGUGCAGUUGGAAGGGGGGCCGUUACACUGUAAGAGAGUGAGUAGCAGGUCUCACAGUGAACCGGUCUCUUUUCUUACUGUGUCACAUCUUUCCCAGUAACUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UAGGUUCCUGCGGUGAU--|UG U UUA AA GUGAG G CAGU GGAAGGGGGGCCG CACUGU GAGA U U GUCA UCUUUUCUCUGGC GUGACA CUCU A UCAAUGACCCUUUCUACAC^GU U CAA -- GGACG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pbv-Mir-128-P1_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGGGGCCGUUACACUGUAAGAGA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Pbv-Mir-128-P1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0038921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UCACAGUGAACCGGUCUCUUU -58
Get sequence
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