MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Pbv-Mir-34-P2a

Family name MIR-34 (all species)
Seed GGCAGUG
Species Burmese python (Python bivittatus)
MiRBase ID pbv-mir-34b
Paralogues Pbv-Mir-34-P1  Pbv-Mir-34-P2b  Pbv-Mir-34-P3a  Pbv-Mir-34-P3b  Pbv-Mir-34-P3c  Pbv-Mir-34-P3d 
Orthologues Aae-Mir-34  Aca-Mir-34-P2a  Aga-Mir-34  Agr-Mir-34  Ami-Mir-34-P2a  Asu-Mir-34  Bge-Mir-34  Bta-Mir-34-P2a  Cbr-Mir-34  Cel-Mir-34  Cfa-Mir-34-P2a  Cin-Mir-34  Cja-Mir-34-P2a  Cli-Mir-34-P2a  Cmi-Mir-34-P2a  Cpi-Mir-34-P2a  Cpo-Mir-34-P2a  Cte-Mir-34  Dan-Mir-34  Dlo-Mir-34  Dma-Mir-34  Dme-Mir-34  Dmo-Mir-34  Dno-Mir-34-P2a  Dpu-Mir-34  Dre-Mir-34-P2a  Dsi-Mir-34  Dya-Mir-34  Ebu-Mir-34-P2a  Eca-Mir-34-P2a  Efe-Mir-34  Esc-Mir-34  Ete-Mir-34-P2a  Gga-Mir-34-P2a  Gja-Mir-34-P2a  Gpa-Mir-34  Gsp-Mir-34  Hmi-Mir-34  Hru-Mir-34  Hsa-Mir-34-P2a  Isc-Mir-34  Laf-Mir-34-P2a  Lch-Mir-34-P2a  Lgi-Mir-34  Lhy-Mir-34  Llo-Mir-34  Loc-Mir-34-P2a  Mdo-Mir-34-P2a  Mgi-Mir-34  Mml-Mir-34-P2a  Mmr-Mir-34-P2a  Mmu-Mir-34-P2a  Mom-Mir-34  Mun-Mir-34-P2a  Neu-Mir-34-P2a-v1  Neu-Mir-34-P2a-v2  Npo-Mir-34  Oan-Mir-34-P2a  Obi-Mir-34  Ocu-Mir-34-P2a  Ofu-Mir-34  Ovu-Mir-34  Pab-Mir-34-P2a  Pau-Mir-34  Pca-Mir-34  Pdu-Mir-34  Pfl-Mir-34  Pmi-Mir-34  Pve-Mir-34  Rno-Mir-34-P2a  Rph-Mir-34  Sha-Mir-34-P2a  Sko-Mir-34  Snu-Mir-34  Spt-Mir-34-P2a  Spu-Mir-34  Sto-Mir-34-P2a  Tca-Mir-34  Tgu-Mir-34-P2a  Tur-Mir-34  War-Mir-34  Xla-Mir-34-P2a1a  Xla-Mir-34-P2a1b  Xla-Mir-34-P2a2a  Xla-Mir-34-P2a2b  Xtr-Mir-34-P2a1  Xtr-Mir-34-P2a2 
Node of Origin (locus) Vertebrata
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(GCA_000186305.2_Python_molurus_bivittatus)		 KE957210.1: 112293-112350 [+]
Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-34-P2a)		 Mir-34-P2a KE957210.1: 112293-112350 [+]
Mir-34-P2b KE957210.1: 113018-113072 [+]
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
GGAUCCUACAGAUAAUCAUGUUUGGUUUGUAGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGUGUGUCUCCCCAGCAAUCACUAGCUUCACUGUCAUCAAAACAAUGUGCAGAAUCCCUUCCGCCAAC
Get precursor sequence
Structure
        10        20          30        40        50         
GGAUCCUACAGAUAAUCAUGU--|  G    UA       U      C       GUGUC 
                       UUG UUUG  GGCAGUG AGUUAG UGAUUGU     \
                       AAC AAAC  CUGUCAC UCGAUC ACUAACG     U
CAACCGCCUUCCCUAAGACGUGU^  A    UA       U      -       ACCCC 
      110       100        90        80         70        60
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU Unknown
MotifsUGUG in loop
Tissue expression
-   +
To
Mature sequence

Pbv-Mir-34-P2a_5p
mirBase accessionMIMAT0038885
Sequence 
0- AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGU -23
Get sequence
Star sequence

Pbv-Mir-34-P2a_3p*
mirBase accessionMIMAT0038886
Sequence 
36- AAUCACUAGCUUCACUGUCAUC -58
Get sequence