MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Npo-Mir-34

Family name MIR-34 (all species)
Seed GGCAGUG
Species Chambered Nautilus (Nautilus pompilius)
MiRBase ID
Paralogues
Orthologues Aae-Mir-34  Aca-Mir-34-P1  Aca-Mir-34-P2a  Aca-Mir-34-P2b  Aca-Mir-34-P3a  Aca-Mir-34-P3c  Aca-Mir-34-P3d  Aga-Mir-34  Agr-Mir-34  Ami-Mir-34-P1  Ami-Mir-34-P2a  Ami-Mir-34-P2b  Ami-Mir-34-P3a  Ami-Mir-34-P3b  Ami-Mir-34-P3c  Ami-Mir-34-P3d  Asu-Mir-34  Bfl-Mir-34-P5a  Bfl-Mir-34-P5b  Bfl-Mir-34-P6a  Bfl-Mir-34-P6b  Bfl-Mir-34-P7  Bfl-Mir-34-P8  Bge-Mir-34  Bla-Mir-34-P5  Bla-Mir-34-P6  Bla-Mir-34-P7  Bla-Mir-34-P8  Bta-Mir-34-P1  Bta-Mir-34-P2a  Bta-Mir-34-P2b  Bta-Mir-34-P3a  Bta-Mir-34-P3b  Bta-Mir-34-P3c  Cbr-Mir-34  Cel-Mir-34  Cfa-Mir-34-P1  Cfa-Mir-34-P2a  Cfa-Mir-34-P2b  Cfa-Mir-34-P3b  Cfa-Mir-34-P3c  Cin-Mir-34  Cja-Mir-34-P1  Cja-Mir-34-P2a  Cja-Mir-34-P2b  Cja-Mir-34-P3a-v1  Cja-Mir-34-P3a-v2  Cja-Mir-34-P3b  Cja-Mir-34-P3c  Cli-Mir-34-P1  Cli-Mir-34-P2a  Cli-Mir-34-P2b  Cli-Mir-34-P3a  Cli-Mir-34-P3b  Cli-Mir-34-P3c  Cli-Mir-34-P3d  Cmi-Mir-34-P1  Cmi-Mir-34-P2a  Cmi-Mir-34-P2b  Cmi-Mir-34-P3a  Cmi-Mir-34-P3b  Cmi-Mir-34-P3c  Cmi-Mir-34-P3d  Cpi-Mir-34-P1  Cpi-Mir-34-P2a  Cpi-Mir-34-P2b  Cpi-Mir-34-P3a  Cpi-Mir-34-P3b  Cpi-Mir-34-P3c  Cpi-Mir-34-P3d  Cpo-Mir-34-P1  Cpo-Mir-34-P2a  Cpo-Mir-34-P2b  Cpo-Mir-34-P3a  Cpo-Mir-34-P3c  Csc-Mir-34-P19a  Csc-Mir-34-P19b  Csc-Mir-34-P19c  Csc-Mir-34-P20  Cte-Mir-34  Dan-Mir-34  Dgr-Mir-34-P21  Dgr-Mir-34-P22  Dlo-Mir-34  Dma-Mir-34  Dme-Mir-34  Dmo-Mir-34  Dno-Mir-34-P1  Dno-Mir-34-P2a  Dno-Mir-34-P2b  Dno-Mir-34-P3a  Dno-Mir-34-P3b  Dno-Mir-34-P3c  Dpu-Mir-34  Dre-Mir-34-P1  Dre-Mir-34-P2a  Dre-Mir-34-P2b  Dsi-Mir-34  Dya-Mir-34  Ebu-Mir-34-P1  Ebu-Mir-34-P2a  Ebu-Mir-34-P2b  Eca-Mir-34-P1  Eca-Mir-34-P2a  Eca-Mir-34-P2b  Eca-Mir-34-P3b  Eca-Mir-34-P3c  Efe-Mir-34  Esc-Mir-34  Ete-Mir-34-P1  Ete-Mir-34-P2a  Ete-Mir-34-P2b  Ete-Mir-34-P3b  Ete-Mir-34-P3c  Gga-Mir-34-P1  Gga-Mir-34-P2a  Gga-Mir-34-P2b  Gga-Mir-34-P3a  Gga-Mir-34-P3b  Gga-Mir-34-P3c  Gga-Mir-34-P3d  Gja-Mir-34-P1  Gja-Mir-34-P2a  Gja-Mir-34-P2b  Gja-Mir-34-P3a  Gja-Mir-34-P3b  Gja-Mir-34-P3c  Gja-Mir-34-P3d  Gmo-Mir-34-P1  Gmo-Mir-34-P3c  Gmo-Mir-34-P3d  Gpa-Mir-34  Gsp-Mir-34  Hme-Mir-34-P11  Hme-Mir-34-P12  Hmi-Mir-34  Hru-Mir-34  Hsa-Mir-34-P1  Hsa-Mir-34-P2a  Hsa-Mir-34-P2b  Hsa-Mir-34-P3a-v1  Hsa-Mir-34-P3a-v2  Hsa-Mir-34-P3b  Hsa-Mir-34-P3c  Isc-Mir-34  Laf-Mir-34-P1  Laf-Mir-34-P2a  Laf-Mir-34-P2b  Laf-Mir-34-P3b  Laf-Mir-34-P3c  Lan-Mir-34-P9  Lan-Mir-34-P10  Lch-Mir-34-P1  Lch-Mir-34-P2a  Lch-Mir-34-P2b  Lch-Mir-34-P3a  Lch-Mir-34-P3b  Lch-Mir-34-P3d  Lgi-Mir-34  Lhy-Mir-34  Llo-Mir-34  Loc-Mir-34-P1  Loc-Mir-34-P2a  Loc-Mir-34-P2b  Loc-Mir-34-P3a  Loc-Mir-34-P3b  Loc-Mir-34-P3c  Loc-Mir-34-P3d  Lpo-Mir-34-P13  Lpo-Mir-34-P14  Lpo-Mir-34-P15  Lpo-Mir-34-P16  Lpo-Mir-34-P17  Lpo-Mir-34-P18  Mal-Mir-34-P1  Mal-Mir-34-P3c  Mal-Mir-34-P3d  Mdo-Mir-34-P1  Mdo-Mir-34-P2a  Mdo-Mir-34-P2b  Mdo-Mir-34-P3b  Mdo-Mir-34-P3c  Mdo-Mir-34-P3d  Mgi-Mir-34  Mml-Mir-34-P1  Mml-Mir-34-P2a  Mml-Mir-34-P2b  Mml-Mir-34-P3b  Mml-Mir-34-P3c  Mmr-Mir-34-P1  Mmr-Mir-34-P2a  Mmr-Mir-34-P2b  Mmr-Mir-34-P3b  Mmr-Mir-34-P3c  Mmu-Mir-34-P1  Mmu-Mir-34-P2a  Mmu-Mir-34-P2b  Mmu-Mir-34-P3a  Mmu-Mir-34-P3b  Mmu-Mir-34-P3c  Mom-Mir-34  Mun-Mir-34-P1  Mun-Mir-34-P2a  Mun-Mir-34-P2b  Mun-Mir-34-P3a  Mun-Mir-34-P3d  Neu-Mir-34-P1  Neu-Mir-34-P2a-v1  Neu-Mir-34-P2a-v2  Neu-Mir-34-P3b  Neu-Mir-34-P3c  Neu-Mir-34-P3d  Oan-Mir-34-P1  Oan-Mir-34-P2a  Oan-Mir-34-P2b  Oan-Mir-34-P3a  Oan-Mir-34-P3b  Oan-Mir-34-P3c  Obi-Mir-34  Ocu-Mir-34-P1  Ocu-Mir-34-P2a  Ocu-Mir-34-P2b  Ocu-Mir-34-P3a  Ocu-Mir-34-P3b  Ocu-Mir-34-P3c  Ofu-Mir-34  Ovu-Mir-34  Pab-Mir-34-P1  Pab-Mir-34-P2a  Pab-Mir-34-P2b  Pab-Mir-34-P3a  Pab-Mir-34-P3b  Pab-Mir-34-P3c  Pau-Mir-34  Pbv-Mir-34-P1  Pbv-Mir-34-P2a  Pbv-Mir-34-P2b  Pbv-Mir-34-P3a  Pbv-Mir-34-P3b  Pbv-Mir-34-P3c  Pbv-Mir-34-P3d  Pca-Mir-34  Pdu-Mir-34  Pfl-Mir-34  Pma-Mir-34-P1  Pma-Mir-34-P3  Pmi-Mir-34  Pve-Mir-34  Rno-Mir-34-P1  Rno-Mir-34-P2a  Rno-Mir-34-P2b  Rno-Mir-34-P3a  Rno-Mir-34-P3b  Rno-Mir-34-P3c  Rph-Mir-34  Sha-Mir-34-P1  Sha-Mir-34-P2a  Sha-Mir-34-P2b  Sha-Mir-34-P3b  Sha-Mir-34-P3c  Sha-Mir-34-P3d  Sko-Mir-34  Snu-Mir-34  Spt-Mir-34-P1  Spt-Mir-34-P2a  Spt-Mir-34-P2b  Spt-Mir-34-P3b  Spt-Mir-34-P3c  Spt-Mir-34-P3d  Spu-Mir-34  Sro-Mir-34-P23  Sro-Mir-34-P24  Sto-Mir-34-P1  Sto-Mir-34-P2a  Sto-Mir-34-P2b  Sto-Mir-34-P3a  Sto-Mir-34-P3b  Sto-Mir-34-P3c  Sto-Mir-34-P3d  Tca-Mir-34  Tgu-Mir-34-P1  Tgu-Mir-34-P2a  Tgu-Mir-34-P2b  Tgu-Mir-34-P3a  Tgu-Mir-34-P3c  Tgu-Mir-34-P3d  Tni-Mir-34-P1  Tni-Mir-34-P3c  Tur-Mir-34  War-Mir-34  Xbo-Mir-34-P25a  Xbo-Mir-34-P25b  Xla-Mir-34-P1a  Xla-Mir-34-P1b  Xla-Mir-34-P2a1a  Xla-Mir-34-P2a1b  Xla-Mir-34-P2a2a  Xla-Mir-34-P2a2b  Xla-Mir-34-P2b1a  Xla-Mir-34-P2b1b  Xla-Mir-34-P2b2a  Xla-Mir-34-P2b2b  Xla-Mir-34-P2c1  Xla-Mir-34-P2c2  Xla-Mir-34-P3a1  Xla-Mir-34-P3a2  Xla-Mir-34-P3b1  Xla-Mir-34-P3b2  Xla-Mir-34-P3c1  Xla-Mir-34-P3c2  Xla-Mir-34-P3d1  Xla-Mir-34-P3d2  Xtr-Mir-34-P1  Xtr-Mir-34-P2a1  Xtr-Mir-34-P2a2  Xtr-Mir-34-P2b1  Xtr-Mir-34-P2b2  Xtr-Mir-34-P3a  Xtr-Mir-34-P3b  Xtr-Mir-34-P3c  Xtr-Mir-34-P3d 
Node of Origin (locus) Bilateria
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(GCA_018389105_NPO)		 JACATO010000333.1: 1074717-1074775 [-] Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
GCUCACCUGUACGGGCGGGGCGUGGUUGUGUGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUUGUGUGCCACGCCAACAACCACUAUCUGCACUCCCAUGGAAACACGUCUGUAUUCCAACAAAAUUCCU
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30        40        50          
GCUCACCUGUACGGGCG--|      G  G     C    UG U   C     U  GUGCC 
                   GGGCGUG UU UGUGG AGUG  G UAG UGGUU GU     \
                   UCUGCAC AA GUACC UCAC  C AUC ACCAA CA     A
UCCUUAAAACAACCUUAUG^      A  G     C    GU U   -     -  ACCGC 
       110       100        90        80         70
Deep sequencing
3' NTU Unknown
MotifsCNNC at 3p(+17), UGUG in loop
Mature sequence

Npo-Mir-34_5p (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
0- UGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUUGU -24
Get sequence
Star sequence

Npo-Mir-34_3p* (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
37- AACCACUAUCUGCACUCCCAUG -59
Get sequence