| MirGeneDB ID | Aga-Mir-2-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GCAGUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African malaria mosquito (Anopheles gambiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | aga-mir-308 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Aga-Mir-2-P1-v1 Aga-Mir-2-P1-v2 Aga-Mir-2-P2a Aga-Mir-2-P2b Aga-Mir-2-P3 Aga-Mir-2-P4-v1 Aga-Mir-2-P4-v2 Aga-Mir-2-P5a1 Aga-Mir-2-P5a2 Aga-Mir-2-P5b Aga-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-2-P8 Asu-Mir-2-o8 Dan-Mir-2-P8 Dme-Mir-2-P8-v1 Dme-Mir-2-P8-v2 Dmo-Mir-2-P8 Dsi-Mir-2-P8 Dya-Mir-2-P8 Gpa-Mir-2-P8 Gsp-Mir-2 Hme-Mir-2-P8 Ple-Mir-2 Tca-Mir-2-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Aparaglossata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_943734735.2_idAnoGambNW_F1_1_genomic) |
NC_064602.1: 98093799-98093860 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGGGAAAUGUACGCUUCUCGUGCGAUGUUUCGCAGUAUAUCCCUGUGAGUUUGCUACUUUUCAAUGGUCAAAUCACAGGAGUAUACUGUGAGAUGUUGCCGGUUACUUAGGCCAGCGAAGAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GGGGAAAUGUACGCUUC---| U UC G CUACUUU UCG GCGAUGUUUCGCAGUAUA CCUGUGA UUUG \ GGC CGUUGUAGAGUGUCAUAU GGACACU AAAC U GAGAAGCGACCGGAUUCAUU^ - GA - UGGUAAC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Aga-Mir-2-P8_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGCAGUAUAUCCCUGUGAGUUUG -23
Get sequence
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| Star sequence | Aga-Mir-2-P8_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0001520 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AAAUCACAGGAGUAUACUGUGAG -62
Get sequence
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