MirGeneDB ID | Dsi-Mir-2-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dsi-mir-308 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dsi-Mir-2-P1-v1 Dsi-Mir-2-P1-v2 Dsi-Mir-2-P2a Dsi-Mir-2-P2b1 Dsi-Mir-2-P2b2 Dsi-Mir-2-P3a Dsi-Mir-2-P3b Dsi-Mir-2-P4a-v1 Dsi-Mir-2-P4a-v2 Dsi-Mir-2-P4b-v1 Dsi-Mir-2-P4b-v2 Dsi-Mir-2-P5 Dsi-Mir-2-P6a Dsi-Mir-2-P6b Dsi-Mir-2-P6c Dsi-Mir-2-P7 Dsi-Mir-2-P9-v1 Dsi-Mir-2-P9-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-2-P8 Aga-Mir-2-P8 Asu-Mir-2-o8 Dan-Mir-2-P8 Dme-Mir-2-P8-v1 Dme-Mir-2-P8-v2 Dmo-Mir-2-P8 Dya-Mir-2-P8 Gpa-Mir-2-P8 Gsp-Mir-2 Hme-Mir-2-P8 Ple-Mir-2 Tca-Mir-2-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Aparaglossata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
2R: 10806835-10806895 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P8) |
Mir-2584
2R: 10767146-10767208 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-2-P8 2R: 10806835-10806895 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGUGGGGGGAAUCACACGUCUCGACGCCUCGCAGUAUAUUUUUGUGUUUUGUUUCGUUUUGCAACUCAAAUCACAGGAUUAUACUGUGAGAUGACCAGCGUGCCAGCAGCAGAAAGCGAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UGGUGGGGGGAAUCACACGUCUCG -------| U U UUUCGUU ACGC CUCGCAGUAUA UUUUGUG UUUG \ UGCG GAGUGUCAUAU AGGACAC AAAC U AAGCGAAAGACGACGACCG----- ACCAGUA^ U U UCAACGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dsi-Mir-2-P8_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGCAGUAUAUUUUUGUGUUUUG -22
Get sequence
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Mature sequence | Dsi-Mir-2-P8_3p |
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mirBase accession | MIMAT0008877 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- AAUCACAGGAUUAUACUGUGAG -61
Get sequence
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