MirGeneDB ID | Hsa-Mir-506-P6b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCACAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-513b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-506-P1 Hsa-Mir-506-P2 Hsa-Mir-506-P3 Hsa-Mir-506-P4a1 Hsa-Mir-506-P4a2 Hsa-Mir-506-P4b Hsa-Mir-506-P5 Hsa-Mir-506-P6a1 Hsa-Mir-506-P6a2 Hsa-Mir-506-P6c Hsa-Mir-506-P7a Hsa-Mir-506-P7b Hsa-Mir-506-P7c Hsa-Mir-506-P8 Hsa-Mir-506-P9 Hsa-Mir-506-P10 Hsa-Mir-506-P11 Hsa-Mir-506-P12 Hsa-Mir-506-P13 Hsa-Mir-506-P29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-506-P6 Cpo-Mir-506-o6 Cpo-Mir-506-P6 Mml-Mir-506-P6b1 Mml-Mir-506-P6b2 Ocu-Mir-506-P6 Rno-Mir-506-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chrX: 147199057-147199114 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P6b) |
Mir-506-P6c
chrX: 147189717-147189774 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P6b chrX: 147199057-147199114 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6a2 chrX: 147213498-147213555 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P6a1 chrX: 147225860-147225917 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1 chrX: 147230753-147230809 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P2 chrX: 147231002-147231059 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P3 chrX: 147236945-147237002 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCACAUUCAGCCAUUCAGUGUACAGUGCCUUUCACAAGGAGGUGUCAUUUAUGUGAACUAAAAUAUAAAUGUCACCUUUUUGAGAGGAGUAAUGUACAGCAUGCACUGCAUAUGUGGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCACAUUCAGCCAUUCAG--| G CU A U GUGAA UGUACA UGC UUC CAAGGAGGUG CAUUUAU C ACAUGU AUG GAG GUUUUUCCAC GUAAAUA U UGGUGUAUACGUCACGUACG^ A AG A U UAAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-506-P6b_5p |
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mirBase accession | MIMAT0005788 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCACAAGGAGGUGUCAUUUAU -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005788 TargetScanVert: hsa-miR-513b-5p miRDB: MIMAT0005788 |
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Star sequence | Hsa-Mir-506-P6b_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0026749 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UAAAUGUCACCUUUUUGAGAGGA -58
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: hsa-miR-513b-3p miRDB: MIMAT0026749 |