MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Laf-Mir-506

Family name MIR-506 (all species)
Seed ACUCAGG
Species African bush elephant (Loxodonta africana)
MiRBase ID
Paralogues
Orthologues Bta-Mir-506-P2a  Bta-Mir-506-P2b1  Bta-Mir-506-P2b2  Bta-Mir-506-P3  Bta-Mir-506-P4  Bta-Mir-506-P5  Cfa-Mir-506-P1  Cfa-Mir-506-P2a  Cfa-Mir-506-P2b  Cfa-Mir-506-P3a  Cfa-Mir-506-P3b  Cfa-Mir-506-P4  Cja-Mir-506-P1a  Cja-Mir-506-P1b  Cja-Mir-506-P1c  Cja-Mir-506-P1d  Cja-Mir-506-P1e  Cja-Mir-506-P2a  Cja-Mir-506-P3  Cja-Mir-506-P4  Cja-Mir-506-P5d1  Cja-Mir-506-P5d2  Cja-Mir-506-P6a  Cja-Mir-506-P6b  Cja-Mir-506-P6c  Cja-Mir-506-P6d  Cja-Mir-506-P6e  Cja-Mir-506-P6o1  Cja-Mir-506-P6o2  Cja-Mir-506-P6o3  Cja-Mir-506-P6o4  Cpo-Mir-506-P2a1  Cpo-Mir-506-P2a2  Cpo-Mir-506-P2b  Cpo-Mir-506-P4  Cpo-Mir-506-P5  Cpo-Mir-506-P26a  Cpo-Mir-506-P26b  Cpo-Mir-506-P26c  Cpo-Mir-506-P26d  Cpo-Mir-506-P26e  Cpo-Mir-506-P26f  Cpo-Mir-506-P26g  Cpo-Mir-506-P27a  Cpo-Mir-506-P27b  Cpo-Mir-506-P27c  Dno-Mir-506-P1i  Dno-Mir-506-P1j  Dno-Mir-506-P1k  Dno-Mir-506-P1l  Dno-Mir-506-P2b  Dno-Mir-506-P3  Dno-Mir-506-P4  Eca-Mir-506-P1m  Eca-Mir-506-P1n  Eca-Mir-506-P1o-v1  Eca-Mir-506-P1o-v2  Eca-Mir-506-P1o-v3  Eca-Mir-506-P1p-v1  Eca-Mir-506-P1p-v2  Eca-Mir-506-P1p-v3  Eca-Mir-506-P2a  Eca-Mir-506-P2b3  Eca-Mir-506-P2b4  Eca-Mir-506-P3  Eca-Mir-506-P4a  Eca-Mir-506-P4b  Eca-Mir-506-P28a  Eca-Mir-506-P28b  Eca-Mir-506-P28c-v1  Eca-Mir-506-P28c-v2  Eca-Mir-506-P28d1  Eca-Mir-506-P28d2  Eca-Mir-506-P28e1  Eca-Mir-506-P28e2  Eca-Mir-506-P28f1  Eca-Mir-506-P28f2  Eca-Mir-506-P28f3  Eca-Mir-506-P29a1  Eca-Mir-506-P29a2  Eca-Mir-506-P29b  Eca-Mir-506-P30a  Eca-Mir-506-P30b1-v1  Eca-Mir-506-P30b1-v2  Eca-Mir-506-P30b2-v1  Eca-Mir-506-P30b2-v2  Eca-Mir-506-P30c1  Eca-Mir-506-P30c2  Eca-Mir-506-P30d  Eca-Mir-506-P31a  Eca-Mir-506-P31b  Eca-Mir-506-P31c  Eca-Mir-506-P32  Eca-Mir-506-P33a  Eca-Mir-506-P33b1  Eca-Mir-506-P33b2  Eca-Mir-506-P34  Eca-Mir-506-P35a-v1  Eca-Mir-506-P35a-v2  Eca-Mir-506-P35b1-v1  Eca-Mir-506-P35b1-v2  Eca-Mir-506-P35b2-v1  Eca-Mir-506-P35b2-v2  Eca-Mir-506-P35c-v1  Eca-Mir-506-P35c-v2  Ete-Mir-506-P5d  Ete-Mir-506-P5e  Hsa-Mir-506-P1a1  Hsa-Mir-506-P1a2  Hsa-Mir-506-P1a3  Hsa-Mir-506-P1b  Hsa-Mir-506-P1c1  Hsa-Mir-506-P1c2  Hsa-Mir-506-P1c3  Hsa-Mir-506-P1d  Hsa-Mir-506-P1e  Hsa-Mir-506-P2b  Hsa-Mir-506-P3  Hsa-Mir-506-P4  Hsa-Mir-506-P5a1  Hsa-Mir-506-P5a2  Hsa-Mir-506-P5b  Hsa-Mir-506-P5c  Hsa-Mir-506-P6a  Hsa-Mir-506-P6b  Hsa-Mir-506-P6c  Hsa-Mir-506-P6d  Hsa-Mir-506-P6e  Mml-Mir-506-P1a  Mml-Mir-506-P1b  Mml-Mir-506-P1c4  Mml-Mir-506-P1c5  Mml-Mir-506-P1c6  Mml-Mir-506-P1d  Mml-Mir-506-P1e  Mml-Mir-506-P2b  Mml-Mir-506-P3  Mml-Mir-506-P4  Mml-Mir-506-P5o1  Mml-Mir-506-P5o2  Mml-Mir-506-P5o3  Mml-Mir-506-P5o4a  Mml-Mir-506-P5o4b  Mml-Mir-506-P6a  Mml-Mir-506-P6b  Mml-Mir-506-P6c  Mml-Mir-506-P6d  Mml-Mir-506-P6e  Mmr-Mir-506-P1o1  Mmr-Mir-506-P1o2  Mmr-Mir-506-P2a  Mmr-Mir-506-P2b  Mmr-Mir-506-P3  Mmr-Mir-506-P4  Mmr-Mir-506-P5  Mmr-Mir-506-P6o5  Mmr-Mir-506-P6o6  Mmr-Mir-506-P6o7  Mmr-Mir-506-P6o8  Mmu-Mir-506-P2b  Mmu-Mir-506-P4  Mmu-Mir-506-P11a  Mmu-Mir-506-P11b1  Mmu-Mir-506-P11b2  Mmu-Mir-506-P11c1  Mmu-Mir-506-P11c2  Mmu-Mir-506-P11d  Mmu-Mir-506-P12  Mmu-Mir-506-P13  Mmu-Mir-506-P14  Mmu-Mir-506-P15  Mmu-Mir-506-P16  Mmu-Mir-506-P17  Mmu-Mir-506-P18  Mmu-Mir-506-P19  Mmu-Mir-506-P20  Mmu-Mir-506-P21  Mmu-Mir-506-P22  Mmu-Mir-506-P23  Mmu-Mir-506-P24  Ocu-Mir-506-P1f  Ocu-Mir-506-P1g  Ocu-Mir-506-P1h  Ocu-Mir-506-P2a  Ocu-Mir-506-P3  Ocu-Mir-506-P4  Ocu-Mir-506-P5  Pab-Mir-506-P1a  Pab-Mir-506-P1b  Pab-Mir-506-P1c7  Pab-Mir-506-P1c8  Pab-Mir-506-P1c9  Pab-Mir-506-P1c10  Pab-Mir-506-P1c11  Pab-Mir-506-P1c12  Pab-Mir-506-P1c13  Pab-Mir-506-P1d  Pab-Mir-506-P1e  Pab-Mir-506-P2b  Pab-Mir-506-P3  Pab-Mir-506-P4  Pab-Mir-506-P5o5  Pab-Mir-506-P5o6  Pab-Mir-506-P5o7  Pab-Mir-506-P5o8  Pab-Mir-506-P6a  Pab-Mir-506-P6b  Pab-Mir-506-P6c  Pab-Mir-506-P6d  Pab-Mir-506-P6e  Rno-Mir-506-P1  Rno-Mir-506-P2b  Rno-Mir-506-P4  Rno-Mir-506-P5  Rno-Mir-506-P11  Rno-Mir-506-P13  Rno-Mir-506-P14  Rno-Mir-506-P15  Rno-Mir-506-P16  Rno-Mir-506-P17  Rno-Mir-506-P18  Rno-Mir-506-P19  Rno-Mir-506-P21  Rno-Mir-506-P22  Rno-Mir-506-P23  Rno-Mir-506-P24  Rno-Mir-506-P25 
Node of Origin (locus) Eutheria
Node of Origin (family) Eutheria
Genome context
(GCA_000001905.1_Loxafr3.0)		 GL010108.1: 3637156-3637213 [+] UCSC Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
CCACCAUCAGCUGAGCUGUGGGUAGUGCCUUACUCAGGGAGGUAUCGAUAACAUACUCUAAAACAUUAUCGGGAUCUCUCUAAGUAGAGUAAUGCUCAACAAGUACAAAGUUUGUGGC
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30        40        50        
CCACCAUCAGCUGAGCUG--|     G   C     C        AU      CAUACU 
                    UGGGUA UGC UUACU AGGGAGGU  CGAUAA      C
                    ACUCGU AUG GAUGA UCUCUCUA  GCUAUU      U
CGGUGUUUGAAACAUGAACA^     A   A     A        GG      ACAAAA 
      110       100        90        80        70        60
Deep sequencing
3' NTU No
MotifsUG at 5p(-14)
Mature sequence

Laf-Mir-506_5p (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
0- UACUCAGGGAGGUAUCGAUAA -21
Get sequence
Co-mature sequence

Laf-Mir-506_3p (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
37- AUCGGGAUCUCUCUAAGUAGA -58
Get sequence