MirGeneDB ID | Mmr-Mir-506-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCACAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mmr-Mir-506-P1o1 Mmr-Mir-506-P1o2 Mmr-Mir-506-P2a Mmr-Mir-506-P2b Mmr-Mir-506-P3 Mmr-Mir-506-P4 Mmr-Mir-506-P6o5 Mmr-Mir-506-P6o6 Mmr-Mir-506-P6o7 Mmr-Mir-506-P6o8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-506-P5 Cja-Mir-506-P5d1 Cja-Mir-506-P5d2 Cpo-Mir-506-P5 Ete-Mir-506-P5d Ete-Mir-506-P5e Hsa-Mir-506-P5a1 Hsa-Mir-506-P5a2 Hsa-Mir-506-P5b Hsa-Mir-506-P5c Laf-Mir-506 Mml-Mir-506-P5o1 Mml-Mir-506-P5o2 Mml-Mir-506-P5o3 Mml-Mir-506-P5o4a Mml-Mir-506-P5o4b Ocu-Mir-506-P5 Pab-Mir-506-P5o5 Pab-Mir-506-P5o6 Pab-Mir-506-P5o7 Pab-Mir-506-P5o8 Rno-Mir-506-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 124061442-124061499 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCACAUUCAGCCAUUCAGUGUGCAGUGCGUUUCACAAGAAGGUGUCAUUCAUGUGAGCCAAAAUAUGAAUGGCACAUUUUUGAGAAAUGUAAUGUACAACAUGUAGUGCAUAUGUGGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CCACAUUCAGCCAUUCAG--| G A G UGAG UGUGCA UGCGUUUC CAAGAA GUGUCAUUCAUG C ACAUGU AUGUAAAG GUUUUU CACGGUAAGUAU C UGGUGUAUACGUGAUGUACA^ A A A AAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Mmr-Mir-506-P5_5p (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUCACAAGAAGGUGUCAUUCAUG -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Mmr-Mir-506-P5_3p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- GAAUGGCACAUUUUUGAGAAAU -58
Get sequence
|