MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Isc-Mir-750

Family name MIR-750 (all species)
Seed CAGAUCU
Species Deer tick (Ixodes scapularis)
MiRBase ID isc-mir-750
Paralogues
Orthologues Aae-Mir-750  Aga-Mir-750  Agr-Mir-750  Asu-Mir-750  Ava-Mir-750-P9  Ava-Mir-750-P10  Bge-Mir-750  Bko-Mir-750  Bpl-Mir-750  Csc-Mir-750-P7  Csc-Mir-750-P8  Cte-Mir-750  Dgr-Mir-750  Dlo-Mir-750  Dma-Mir-750  Dpu-Mir-750  Eba-Mir-750  Efe-Mir-750-P1  Efe-Mir-750-P2  Efe-Mir-750-P3  Esc-Mir-750  Hme-Mir-750  Hru-Mir-750  Lan-Mir-750  Lgi-Mir-750  Llo-Mir-750  Lpo-Mir-750-P4  Lpo-Mir-750-P5  Lpo-Mir-750-P6  Mgi-Mir-750  Mom-Mir-750  Npo-Mir-750  Obi-Mir-750  Ofu-Mir-750  Ovu-Mir-750  Pau-Mir-750  Pca-Mir-750  Pcr-Mir-750  Pdu-Mir-750  Pve-Mir-750  Rph-Mir-750  Sma-Mir-750  Sme-Mir-750  Snu-Mir-750  Tca-Mir-750  Tur-Mir-750  War-Mir-750 
Node of Origin (locus) Protostomia
Node of Origin (family) Protostomia
Genome context
(GCF_016920785.2_ASM1692078v2_ISC)		 NW_024609838.1: 27830443-27830507 [-] Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
CCGGCAGCCAUGGGUUGGCCGUCCCACUCGAGUUGGAAGUGGGAUCCUGACACUUGAGCGCUGUCGGUGGUGCCAGAUCUAACUCUUCCAGCUCAGGUGAGGUACCGGUAUUUUCUGUCGACAGC
Get precursor sequence
Structure
        10        20          30        40          50        60 
CCGGCAGCCAUGGGUUGGCC  -  -   UC          UG--|    C  A  CUUGAGCG 
                    GU CC CAC  GAGUUGGAAG    GGAUC UG CA        C
                    CA GG GUG  CUCGACCUUC    UCUAG AC GU        U
CGACAGCUGUCUUUUAUGGC  U  A   GA          UCAA^    -  C  GGUGGCUG 
   120       110       100        90        80         70
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsNo
Tissue expression
-   +
Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Sa Sa To
Star sequence

Isc-Mir-750_5p*
mirBase accessionNone
Sequence 
0- AGUUGGAAGUGGGAUCCUGACA -22
Get sequence
Mature sequence

Isc-Mir-750_3p
mirBase accessionMIMAT0012704
Sequence 
42- CCAGAUCUAACUCUUCCAGCUCA -65
Get sequence