| MirGeneDB ID | Lgi-Mir-750 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-750 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGAUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Owl limpet (Lottia gigantea) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | lgi-mir-750 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-750 Asu-Mir-750 Bge-Mir-750 Bpl-Mir-750 Cgi-Mir-750 Csc-Mir-750-P8 Csc-Mir-750-P9 Cte-Mir-750 Dma-Mir-750 Dpu-Mir-750 Efe-Mir-750-P1 Efe-Mir-750-P2 Efe-Mir-750-P3 Esc-Mir-750 Hme-Mir-750 Isc-Mir-750 Lan-Mir-750 Lpo-Mir-750-P5 Lpo-Mir-750-P6 Lpo-Mir-750-P7 Npo-Mir-750 Obi-Mir-750 Ovu-Mir-750 Sme-Mir-750 Tca-Mir-750 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Lotgi1) |
LOTGIsca_236: 113228-113290 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-750) |
Mir-750
LOTGIsca_236: 113228-113290 [+]
Ensembl
Mir-1175 LOTGIsca_236: 116361-116422 [+] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAAGGAUUAUGGGUAAUACAUGUUUCAGUUCGUUGGAAGAUUCGACCUUGACAUUGUUCCAUAGAAUUUGUCAGAUCUAACUCUUCCAGCUCAUUGAGAUUUGUUUAAAAACAUCGUUGAUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GAAGGAUUAUGGGUAAU-- U UC -| C CC UUGUUCC ACA GUUUCAGU GUUGGAAGA UU GA UUGACA \ UGU UAGAGUUA CGACCUUCU AA CU GACUGU A GUUAGUUGCUACAAAAAUU U CU C^ U A- UUAAGAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lgi-Mir-750_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGUUGGAAGAUUCGACCUUGACA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Lgi-Mir-750_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0009600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UCAGAUCUAACUCUUCCAGCUCA -63
Get sequence
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