MirGeneDB ID | Mmr-Mir-1329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1329 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACGGUGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-1329-v1 Aca-Mir-1329-v2 Ami-Mir-1329 Bta-Mir-1329 Cli-Mir-1329-v1 Cli-Mir-1329-v2 Cmi-Mir-1329 Cpi-Mir-1329-v1 Cpi-Mir-1329-v2 Ebu-Mir-1329 Eca-Mir-1329 Gga-Mir-1329-v1 Gga-Mir-1329-v2 Gja-Mir-1329-v1 Gja-Mir-1329-v2 Laf-Mir-1329 Mdo-Mir-1329 Mun-Mir-1329 Neu-Mir-1329 Oan-Mir-1329-v1 Oan-Mir-1329-v2 Pbv-Mir-1329 Pma-Mir-1329 Sha-Mir-1329 Spt-Mir-1329 Sto-Mir-1329 Tgu-Mir-1329-v1 Tgu-Mir-1329-v2 Xla-Mir-1329-P1 Xla-Mir-1329-P2 Xtr-Mir-1329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007668.1: 149861655-149861714 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAAGGUGGAAUCUCAGUCUGGUUGUAGGGGUACGGUGAUCACGUUGCGACAGUUUCUCAAGCGAUAGCCUCGUAGCUUGGUCACGAUAUCCGUAUGACACAGAUAGCUGCUAUUUCAUCCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GAAGGUGGAAUCUCAGU- -| UG G CG C CA UUCUCA CUG GU UA GGGUA GUGAUCA GUUGCGA GU \ GAC CA AU CCUAU CACUGGU CGAUGCU CG A CCUACUUUAUCGUCGAUA A^ GU G AG U C- AUAGCG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmr-Mir-1329_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACGGUGAUCACGUUGCGACAGU -23
Get sequence
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Star sequence | Mmr-Mir-1329_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- CCUCGUAGCUUGGUCACGAUAUC -60
Get sequence
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