MirGeneDB ID | Mmu-Mir-148-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-148 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAGUGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-148a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mmu-Mir-148-P3 Mmu-Mir-148-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-148-P1 Bta-Mir-148-P1 Cfa-Mir-148-P1 Cja-Mir-148-P1 Cli-Mir-148-P1 Cli-Mir-148-P1-as Cmi-Mir-148-P1 Cpi-Mir-148-P1 Cpo-Mir-148-P1 Dno-Mir-148-P1 Ebu-Mir-148 Eca-Mir-148-P1 Ete-Mir-148-P1 Gga-Mir-148-P1 Gja-Mir-148-P1 Hsa-Mir-148-P1 Laf-Mir-148-P1 Lch-Mir-148-P1 Loc-Mir-148-P1 Mdo-Mir-148-P1 Mml-Mir-148-P1 Mmr-Mir-148-P1 Mun-Mir-148-P1 Oan-Mir-148-P1 Ocu-Mir-148-P1 Pab-Mir-148-P1 Pbv-Mir-148-P1 Pma-Mir-148-o1 Rno-Mir-148-P1 Spt-Mir-148-P1 Sto-Mir-148-P1 Tgu-Mir-148-P1 Tgu-Mir-148-P1-as Xla-Mir-148-P1a Xla-Mir-148-P1b Xtr-Mir-148-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr6: 51269829-51269888 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGGAAGACAGCCAGUUUGGUCUUUUGAGACAAAGUUCUGAGACACUCCGACUCUGAGUAUGAUAGAAGUCAGUGCACUACAGAACUUUGUCUCUAGAGGCUGUGGUCGCCGCCUCCCCGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AGGAAGACAGCCAGUUU-- U - A-| CC CUGAGU GGUCUUU GAGACAAAGUUCUG AG CACU GACU A UCGGAGA CUCUGUUUCAAGAC UC GUGA CUGA U CGCCCCUCCGCCGCUGGUG U A AC^ -- AGAUAG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmu-Mir-148-P1_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0004617 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AAAGUUCUGAGACACUCCGACU -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004617 TargetScanVert: mmu-miR-148a-5p miRDB: MIMAT0004617 |
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Mature sequence | Mmu-Mir-148-P1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UCAGUGCACUACAGAACUUUGU -60
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000516 TargetScanVert: mmu-miR-148a-3p miRDB: MIMAT0000516 |