MirGeneDB ID | Mom-Mir-2-P12h | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCACAG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mossy chiton (Mopalia muscosa) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mom-Mir-2-P12f Mom-Mir-2-P12g Mom-Mir-2-P12i Mom-Mir-2-P12j Mom-Mir-2-P12k Mom-Mir-2-o85-v1 Mom-Mir-2-o85-v2 Mom-Mir-2-o86 Mom-Mir-2-o88 Mom-Mir-2-o89 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cte-Mir-2-P12 Dgr-Mir-2-P12 Esc-Mir-2-P12 Gsp-Mir-2 Hru-Mir-2-P12 Lhy-Mir-2-P12 Llo-Mir-2-P12 Mgi-Mir-2-P12 Npo-Mir-2-P12 Obi-Mir-2-P12 Ofu-Mir-2-P12 Ovu-Mir-2-P12 Pau-Mir-2-P12 Pdu-Mir-2-P12 Ple-Mir-2 Pve-Mir-2-P12 Rph-Mir-2-P12 War-Mir-2-P12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | M. mucosa | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_031763545.1_ASM3176354v1_genomic_Mom) |
JARFOD010082610.1: 1295-1352 [+] Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUAUUUUGUUUCUUGAACUCCAUUCCAUACUGGCUAAGUGUCUGUGAUGUGUUUUAGUUCUAUCAUAUCACAGUCUGCUUAGAUCAGUAUGGUAUGUUGUGUAAUUCAGCCUUCAAAAGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CUAUUUUGUUUCUUGAA-- UC U - GU-| UUUUA C CAU CCAUACUGG CUAAGU CUGUGAUGUG G G GUA GGUAUGACU GAUUCG GACACUAUAC U AAAACUUCCGACUUAAUGU UU U A UCU^ UAUCU 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mom-Mir-2-P12h_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGCUAAGUGUCUGUGAUGUG -21
Get sequence
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Mature sequence | Mom-Mir-2-P12h_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UAUCACAGUCUGCUUAGAUCAGU -58
Get sequence
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