| MirGeneDB ID | Lgi-Mir-1992-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1992 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGCAGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Owl limpet (Lottia gigantea) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | lgi-mir-1992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Lgi-Mir-1992-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cgi-Mir-1992 Cte-Mir-1992 Esc-Mir-1992 Lan-Mir-1992 Npo-Mir-1992 Obi-Mir-1992 Ovu-Mir-1992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | L. gigantea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Platytrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Lotgi1) |
LOTGIsca_253: 35945-36002 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAUUUUAUCAGACAGAAAAUGUUGUUGAUAAGUCAGUGGAUGAUUGCAGGAUAUUCCAUCAGUUAUCAGCAGUUGUACCACUGAUUUGUUAAUGAUAUCCAUCCUUCAACUAGACAUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UAUUUUAUCAGACAGAAA-- UG -|UG AG UUCC AUGU UUGAUAAGUCAGUGG A AUUGC GAUA A UAUA AAUUGUUUAGUCACC U UGACG CUAU U UUACAGAUCAACUUCCUACC GU A^GU A- UGAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lgi-Mir-1992-P2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUCAGUGGAUGAUUGCAGGAUA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Lgi-Mir-1992-P2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0009722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UCAGCAGUUGUACCACUGAUUUG -58
Get sequence
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