MirGeneDB ID | Dno-Mir-130-P1c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-130 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGUGCAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-130a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dno-Mir-130-P2a Dno-Mir-130-P2b Dno-Mir-130-P3b Dno-Mir-130-P4a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-130-P1c Ami-Mir-130-P1c Bta-Mir-130-P1c Cfa-Mir-130-P1c Cja-Mir-130-P1c Cpi-Mir-130-P1c Cpo-Mir-130-P1c Eca-Mir-130-P1c Ete-Mir-130-P1c Gja-Mir-130-P1c Hsa-Mir-130-P1c Laf-Mir-130-P1c Lch-Mir-130-P1c Mdo-Mir-130-P1c Mml-Mir-130-P1c Mmr-Mir-130-P1c Mmu-Mir-130-P1c Mun-Mir-130-P1c Neu-Mir-130-P1c Oan-Mir-130-P1c Ocu-Mir-130-P1c Pab-Mir-130-P1c Pbv-Mir-130-P1c Rno-Mir-130-P1c Sha-Mir-130-P1c Spt-Mir-130-P1c Sto-Mir-130-P1c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH570419: 1698085-1698146 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGGGCCGGCACGCCUCUGCUGCUGGCCAGAGCUCUUUUCACAUUGUGCUACUGUCUGCACCUAUUACUAGCAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAUUGGCCAUGUAGUGCUACCCAGCUCCGGCUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AGGGCCGGCACGCCUCU- -| A C UG A GUCUGCA GCUGC UGGCCAG GCUCUUUU ACAUUG CU CU C UGAUG ACCGGUU CGGGAAAA UGUAAC GA GA C GUCGGCCUCGACCCAUCG U^ A U GU C UCAUUAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dno-Mir-130-P1c_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0047627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GCUCUUUUCACAUUGUGCUACU -22
Get sequence
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Mature sequence | Dno-Mir-130-P1c_3p |
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mirBase accession | MIMAT0047628 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU -62
Get sequence
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