| MirGeneDB ID | Dno-Mir-430-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-302d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dno-Mir-430-P1 Dno-Mir-430-P2 Dno-Mir-430-P3 Dno-Mir-430-P5 Dno-Mir-430-P6 Dno-Mir-430-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-430-P4 Bta-Mir-430-P4 Cfa-Mir-430-P4 Cja-Mir-430-P4 Cli-Mir-430-P4 Cmi-Mir-430-P4 Cpi-Mir-430-P4 Cpo-Mir-430-P4 Eca-Mir-430-P4 Ete-Mir-430-P4 Gga-Mir-430-P4 Hsa-Mir-430-P4 Laf-Mir-430-P4 Mdo-Mir-430-P4 Mml-Mir-430-P4 Mmr-Mir-430-P4 Mmu-Mir-430-P4 Oan-Mir-430-P4 Ocu-Mir-430-P4 Pab-Mir-430-P4 Rno-Mir-430-P4 Spt-Mir-430-P4 Sto-Mir-430-P4 Tgu-Mir-430-P4 Xla-Mir-430-o4a Xla-Mir-430-o4b Xtr-Mir-430-o4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH580080: 1519185-1519244 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P4) |
Mir-92-P2a
JH580080: 1519066-1519125 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P4 JH580080: 1519185-1519244 [-] UCSC Ensembl Mir-430-P3 JH580080: 1519344-1519404 [-] UCSC Ensembl Mir-430-P2 JH580080: 1519526-1519585 [-] UCSC Ensembl Mir-430-P1 JH580080: 1519661-1519717 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAGGCUUAAGCCAGAAAAGGGACCCCCUCUACUUUAACAUGGAAGCACUUGCUGUGAGCUAUUUUAUUAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGUGGUGAAUCCUACUUAACCUUCAAUUGUGUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UAGGCUUAAGCCAGAAAA-- CCC-| UC U CUGUGAG GGGA CC UACUU AACAUGGAAGCACUUG C UCCU GG GUGAG UUGUACCUUCGUGAAU U UUGUGUUAACUUCCAAUUCA AAGU^ U- U UAUUUUA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-430-P4_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0047797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUUUAACAUGGAAGCACUUGC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-430-P4_3p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047798 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU -60
Get sequence
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