| MirGeneDB ID | Dno-Mir-430-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-302b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dno-Mir-430-P2 Dno-Mir-430-P3 Dno-Mir-430-P4 Dno-Mir-430-P5 Dno-Mir-430-P6 Dno-Mir-430-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-430-P1 Ami-Mir-430-P1 Bta-Mir-430-P1 Cfa-Mir-430-P1 Cli-Mir-430-P1 Cmi-Mir-430-P1 Cpi-Mir-430-P1 Cpo-Mir-430-P1 Dre-Mir-430-o1a Dre-Mir-430-o1b1 Dre-Mir-430-o1b2 Dre-Mir-430-o1b3 Dre-Mir-430-o1b4 Dre-Mir-430-o1b5 Dre-Mir-430-o1b6 Dre-Mir-430-o1b7 Dre-Mir-430-o1b8 Dre-Mir-430-o1c Dre-Mir-430-o1d1 Dre-Mir-430-o1d2 Dre-Mir-430-o1d3 Dre-Mir-430-o1d4 Dre-Mir-430-o1d5 Dre-Mir-430-o1d6 Dre-Mir-430-o1d7 Dre-Mir-430-o1e1 Dre-Mir-430-o1e2 Dre-Mir-430-o1e3 Ete-Mir-430-P1 Gga-Mir-430-P1 Hsa-Mir-430-P1 Mdo-Mir-430-P1 Mml-Mir-430-P1 Mmu-Mir-430-P1 Mun-Mir-430-P1 Oan-Mir-430-P1 Ocu-Mir-430-P1 Rno-Mir-430-P1 Sha-Mir-430-P1 Spt-Mir-430-P1 Sto-Mir-430-P1 Tgu-Mir-430-P1 Xla-Mir-430-P1a Xla-Mir-430-P1b Xtr-Mir-430-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH580080: 1519661-1519717 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P1) |
Mir-92-P2a
JH580080: 1519066-1519125 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P4 JH580080: 1519185-1519244 [-] UCSC Ensembl Mir-430-P3 JH580080: 1519344-1519404 [-] UCSC Ensembl Mir-430-P2 JH580080: 1519526-1519585 [-] UCSC Ensembl Mir-430-P1 JH580080: 1519661-1519717 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGUCAUGUAGAAUGGACUGGACUCCCUUCAACUUUAACAUGGAGGUACUUUCUGUUUCUUAAAGUAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAGAAGUGUAUUCAAUUUGACCUUCUGGAUGAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GGUCAUGUAGAAUGGAC--| CUCC A UU U GUUU UGGA CUUC ACU AACAUGGAGGUACUU CU \ ACUU GAAG UGA UUGUACCUUCGUGAA GA C AAGUAGGUCUUCCAGUUUA^ AUGU A UU U AAUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-430-P1_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUUUAACAUGGAGGUACUUUCU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-430-P1_3p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047794 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG -57
Get sequence
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