MirGeneDB 3.0

MirGeneDB ID

Mml-Mir-430-P5

Family name MIR-430 (all species)
Seed GUGCCGC
Species Rhesus monkey (Macaca mulatta)
MiRBase ID mml-mir-371
Paralogues Mml-Mir-430-P1  Mml-Mir-430-P2  Mml-Mir-430-P3  Mml-Mir-430-P4  Mml-Mir-430-P6  Mml-Mir-430-P7  Mml-Mir-430-P8  Mml-Mir-430-P9  Mml-Mir-430-P10  Mml-Mir-430-P12c  Mml-Mir-430-P12d  Mml-Mir-430-P12e  Mml-Mir-430-P14a  Mml-Mir-430-P14b  Mml-Mir-430-P15  Mml-Mir-430-P16  Mml-Mir-430-P17  Mml-Mir-430-P18  Mml-Mir-430-P20  Mml-Mir-430-P21  Mml-Mir-430-P22  Mml-Mir-430-P24  Mml-Mir-430-P25  Mml-Mir-430-P27a  Mml-Mir-430-P27b  Mml-Mir-430-P28  Mml-Mir-430-P29a  Mml-Mir-430-P29b-v1  Mml-Mir-430-P29b-v2  Mml-Mir-430-P29c  Mml-Mir-430-P30  Mml-Mir-430-P31  Mml-Mir-430-P32a1  Mml-Mir-430-P32a2  Mml-Mir-430-P32b  Mml-Mir-430-P33  Mml-Mir-430-P34  Mml-Mir-430-P36a1  Mml-Mir-430-P36a2  Mml-Mir-430-P36b  Mml-Mir-430-P36c  Mml-Mir-430-P38  Mml-Mir-430-P39  Mml-Mir-430-P42  Mml-Mir-430-P43  Mml-Mir-430-P44  Mml-Mir-430-P45a  Mml-Mir-430-P45b 
Orthologues Bta-Mir-430-P5  Cfa-Mir-430-P5d1  Cfa-Mir-430-P5d2  Cja-Mir-430-P5  Cpo-Mir-430-P5  Dno-Mir-430-P5  Eca-Mir-430-P5  Ete-Mir-430-P5  Hsa-Mir-430-P5  Laf-Mir-430-P5  Mmr-Mir-430-P5e  Mmr-Mir-430-P5f  Mmu-Mir-430-P5a  Mmu-Mir-430-P5b  Mmu-Mir-430-P5c  Ocu-Mir-430-P5  Pab-Mir-430-P5  Rno-Mir-430-P5a  Rno-Mir-430-P5b  Rno-Mir-430-P5c  Xla-Mir-430-o5o1  Xla-Mir-430-o5o2  Xla-Mir-430-o5p1  Xla-Mir-430-o5p2  Xla-Mir-430-o5q1  Xla-Mir-430-o5q2  Xla-Mir-430-o5r  Xla-Mir-430-o5s  Xtr-Mir-430-o5a1  Xtr-Mir-430-o5a2  Xtr-Mir-430-o5a3  Xtr-Mir-430-o5a4  Xtr-Mir-430-o5a5  Xtr-Mir-430-o5a6  Xtr-Mir-430-o5a7  Xtr-Mir-430-o5a8  Xtr-Mir-430-o5a9  Xtr-Mir-430-o5a10  Xtr-Mir-430-o5a11  Xtr-Mir-430-o5a12  Xtr-Mir-430-o5a13  Xtr-Mir-430-o5a14  Xtr-Mir-430-o5a15  Xtr-Mir-430-o5a16  Xtr-Mir-430-o5a17  Xtr-Mir-430-o5a18  Xtr-Mir-430-o5a19  Xtr-Mir-430-o5a20  Xtr-Mir-430-o5a21  Xtr-Mir-430-o5a22  Xtr-Mir-430-o5a23  Xtr-Mir-430-o5b  Xtr-Mir-430-o5c1  Xtr-Mir-430-o5c2  Xtr-Mir-430-o5c3  Xtr-Mir-430-o5c4  Xtr-Mir-430-o5c5  Xtr-Mir-430-o5c6  Xtr-Mir-430-o5c7  Xtr-Mir-430-o5c8  Xtr-Mir-430-o5c9  Xtr-Mir-430-o5c10  Xtr-Mir-430-o5c11  Xtr-Mir-430-o5c12  Xtr-Mir-430-o5c13  Xtr-Mir-430-o5c14  Xtr-Mir-430-o5c15  Xtr-Mir-430-o5c16  Xtr-Mir-430-o5c17  Xtr-Mir-430-o5c18  Xtr-Mir-430-o5c19  Xtr-Mir-430-o5c20  Xtr-Mir-430-o5c21  Xtr-Mir-430-o5c22  Xtr-Mir-430-o5c23  Xtr-Mir-430-o5c24  Xtr-Mir-430-o5c25  Xtr-Mir-430-o5d1  Xtr-Mir-430-o5d2  Xtr-Mir-430-o5e  Xtr-Mir-430-o5f1  Xtr-Mir-430-o5f2  Xtr-Mir-430-o5g  Xtr-Mir-430-o5h  Xtr-Mir-430-o5j  Xtr-Mir-430-o5k1  Xtr-Mir-430-o5k2  Xtr-Mir-430-o5k3  Xtr-Mir-430-o5k4  Xtr-Mir-430-o5k5  Xtr-Mir-430-o5k6  Xtr-Mir-430-o5k7  Xtr-Mir-430-o5k8  Xtr-Mir-430-o5k9  Xtr-Mir-430-o5k10  Xtr-Mir-430-o5k11  Xtr-Mir-430-o5k12  Xtr-Mir-430-o5k13  Xtr-Mir-430-o5k14  Xtr-Mir-430-o5k15  Xtr-Mir-430-o5k16  Xtr-Mir-430-o5k17  Xtr-Mir-430-o5k18  Xtr-Mir-430-o5k19  Xtr-Mir-430-o5k20  Xtr-Mir-430-o5k21  Xtr-Mir-430-o5k22  Xtr-Mir-430-o5k23  Xtr-Mir-430-o5k24  Xtr-Mir-430-o5k25  Xtr-Mir-430-o5k26  Xtr-Mir-430-o5k27  Xtr-Mir-430-o5l1  Xtr-Mir-430-o5l2  Xtr-Mir-430-o5l3  Xtr-Mir-430-o5l4  Xtr-Mir-430-o5l5  Xtr-Mir-430-o5l6  Xtr-Mir-430-o5l7  Xtr-Mir-430-o5l8  Xtr-Mir-430-o5l9  Xtr-Mir-430-o5l10  Xtr-Mir-430-o5l11  Xtr-Mir-430-o5l12  Xtr-Mir-430-o5l13  Xtr-Mir-430-o5l14  Xtr-Mir-430-o5l15  Xtr-Mir-430-o5l16  Xtr-Mir-430-o5l17  Xtr-Mir-430-o5l18  Xtr-Mir-430-o5l19  Xtr-Mir-430-o5m  Xtr-Mir-430-o5n1  Xtr-Mir-430-o5n2 
Node of Origin (locus) Eutheria
Node of Origin (family) Vertebrata
Genome context
(GCA_003339765.3_Mmul_10_traces)
CM014354.1: 53555343-53555404 [+] UCSC Ensembl
Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-430-P5)
Mir-430-P32a2 CM014354.1: 53507505-53507564 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P29c CM014354.1: 53509478-53509536 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P33 CM014354.1: 53510678-53510743 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P44 CM014354.1: 53516856-53516916 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P31 CM014354.1: 53518551-53518611 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P39 CM014354.1: 53520125-53520184 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P32b CM014354.1: 53522610-53522669 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P45a CM014354.1: 53524156-53524217 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P45b CM014354.1: 53528832-53528893 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P5 CM014354.1: 53555343-53555404 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P6 CM014354.1: 53555552-53555610 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P7 CM014354.1: 53556259-53556319 [+] UCSC Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
CCGCCUUGCCGCAUCCCCUCAGCCUGUGGCACUCAAACUGUGGGGGCACUUUCUGCUCUCUGGUGAAAAAAGUGCCGCCAUGUUUUGAGUGUUACCGAUUGAGAAAACCCGCCAUUUUGGUA
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30        40        50        60
CCGCCUUGCCGCAUCCC--|    CCU            CU    G        CUGCUCU 
                   CUCAG   GUGGCACUCAAA  GUGG GGCACUUU       C
                   GAGUU   CAUUGUGAGUUU  UACC CCGUGAAA       U
AUGGUUUUACCGCCCAAAA^    AGC            UG    G        AAAGUGG 
120       110       100        90        80        70
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsCNNC at 3p(+17)
Tissue expression
 +
Bo Br Br Br He Ki Li Lu Ly Sk Sp Te Th
Star sequence

Mml-Mir-430-P5_5p*

mirBase accessionMIMAT0006296
Sequence
0- ACUCAAACUGUGGGGGCACUUU -22
Get sequence
Proposed targets TargetScanVert: mml-miR-371-5p
Mature sequence

Mml-Mir-430-P5_3p

mirBase accessionMIMAT0006297
Sequence
40- AGUGCCGCCAUGUUUUGAGUGU -62
Get sequence
Proposed targets TargetScanVert: mml-miR-371-3p